Protein–RNA interactions for Protein: Q15628

TRADD, Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRADDQ15628 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TRADDQ15628 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
TRADDQ15628 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
TRADDQ15628 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21■□□□□ 0.95
TRADDQ15628 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TRADDQ15628 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRADDQ15628 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRADDQ15628 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRADDQ15628 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRADDQ15628 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRADDQ15628 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRADDQ15628 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TRADDQ15628 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRADDQ15628 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TRADDQ15628 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TRADDQ15628 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRADDQ15628 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRADDQ15628 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRADDQ15628 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRADDQ15628 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRADDQ15628 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRADDQ15628 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRADDQ15628 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRADDQ15628 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRADDQ15628 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRADDQ15628 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRADDQ15628 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRADDQ15628 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRADDQ15628 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRADDQ15628 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRADDQ15628 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRADDQ15628 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRADDQ15628 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRADDQ15628 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRADDQ15628 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRADDQ15628 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRADDQ15628 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRADDQ15628 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
TRADDQ15628 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRADDQ15628 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRADDQ15628 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRADDQ15628 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRADDQ15628 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRADDQ15628 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRADDQ15628 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRADDQ15628 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRADDQ15628 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRADDQ15628 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRADDQ15628 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRADDQ15628 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRADDQ15628 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRADDQ15628 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRADDQ15628 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRADDQ15628 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRADDQ15628 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRADDQ15628 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRADDQ15628 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRADDQ15628 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRADDQ15628 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRADDQ15628 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRADDQ15628 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
TRADDQ15628 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRADDQ15628 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRADDQ15628 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRADDQ15628 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRADDQ15628 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRADDQ15628 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRADDQ15628 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRADDQ15628 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
TRADDQ15628 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRADDQ15628 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRADDQ15628 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRADDQ15628 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRADDQ15628 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRADDQ15628 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRADDQ15628 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRADDQ15628 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRADDQ15628 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRADDQ15628 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRADDQ15628 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRADDQ15628 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRADDQ15628 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
TRADDQ15628 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRADDQ15628 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRADDQ15628 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRADDQ15628 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRADDQ15628 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRADDQ15628 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRADDQ15628 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRADDQ15628 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRADDQ15628 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRADDQ15628 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRADDQ15628 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRADDQ15628 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRADDQ15628 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRADDQ15628 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRADDQ15628 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRADDQ15628 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRADDQ15628 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
TRADDQ15628 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
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