Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SKIV2LQ15477 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SKIV2LQ15477 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SKIV2LQ15477 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SKIV2LQ15477 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SKIV2LQ15477 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SKIV2LQ15477 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SKIV2LQ15477 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SKIV2LQ15477 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SKIV2LQ15477 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SKIV2LQ15477 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SKIV2LQ15477 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SKIV2LQ15477 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SKIV2LQ15477 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SKIV2LQ15477 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SKIV2LQ15477 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SKIV2LQ15477 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SKIV2LQ15477 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SKIV2LQ15477 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SKIV2LQ15477 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SKIV2LQ15477 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SKIV2LQ15477 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SKIV2LQ15477 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SKIV2LQ15477 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SKIV2LQ15477 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SKIV2LQ15477 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SKIV2LQ15477 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SKIV2LQ15477 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SKIV2LQ15477 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SKIV2LQ15477 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SKIV2LQ15477 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SKIV2LQ15477 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SKIV2LQ15477 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SKIV2LQ15477 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SKIV2LQ15477 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SKIV2LQ15477 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SKIV2LQ15477 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SKIV2LQ15477 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SKIV2LQ15477 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SKIV2LQ15477 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SKIV2LQ15477 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SKIV2LQ15477 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SKIV2LQ15477 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SKIV2LQ15477 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SKIV2LQ15477 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SKIV2LQ15477 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SKIV2LQ15477 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SKIV2LQ15477 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SKIV2LQ15477 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SKIV2LQ15477 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SKIV2LQ15477 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SKIV2LQ15477 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SKIV2LQ15477 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SKIV2LQ15477 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SKIV2LQ15477 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SKIV2LQ15477 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SKIV2LQ15477 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SKIV2LQ15477 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SKIV2LQ15477 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SKIV2LQ15477 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SKIV2LQ15477 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SKIV2LQ15477 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SKIV2LQ15477 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SKIV2LQ15477 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SKIV2LQ15477 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SKIV2LQ15477 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SKIV2LQ15477 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SKIV2LQ15477 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SKIV2LQ15477 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SKIV2LQ15477 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SKIV2LQ15477 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SKIV2LQ15477 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SKIV2LQ15477 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SKIV2LQ15477 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SKIV2LQ15477 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SKIV2LQ15477 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SKIV2LQ15477 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SKIV2LQ15477 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SKIV2LQ15477 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SKIV2LQ15477 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SKIV2LQ15477 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SKIV2LQ15477 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SKIV2LQ15477 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SKIV2LQ15477 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SKIV2LQ15477 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SKIV2LQ15477 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SKIV2LQ15477 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SKIV2LQ15477 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SKIV2LQ15477 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SKIV2LQ15477 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SKIV2LQ15477 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SKIV2LQ15477 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SKIV2LQ15477 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SKIV2LQ15477 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SKIV2LQ15477 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SKIV2LQ15477 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SKIV2LQ15477 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SKIV2LQ15477 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SKIV2LQ15477 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SKIV2LQ15477 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms