Protein–RNA interactions for Protein: Q15270

NKX1-1, NK1 transcription factor-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-1Q15270 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NKX1-1Q15270 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
NKX1-1Q15270 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
NKX1-1Q15270 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NKX1-1Q15270 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NKX1-1Q15270 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NKX1-1Q15270 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NKX1-1Q15270 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NKX1-1Q15270 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NKX1-1Q15270 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NKX1-1Q15270 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NKX1-1Q15270 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NKX1-1Q15270 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
NKX1-1Q15270 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NKX1-1Q15270 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NKX1-1Q15270 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NKX1-1Q15270 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NKX1-1Q15270 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NKX1-1Q15270 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NKX1-1Q15270 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NKX1-1Q15270 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NKX1-1Q15270 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NKX1-1Q15270 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NKX1-1Q15270 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NKX1-1Q15270 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NKX1-1Q15270 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NKX1-1Q15270 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NKX1-1Q15270 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NKX1-1Q15270 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NKX1-1Q15270 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NKX1-1Q15270 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NKX1-1Q15270 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NKX1-1Q15270 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NKX1-1Q15270 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NKX1-1Q15270 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NKX1-1Q15270 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NKX1-1Q15270 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NKX1-1Q15270 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NKX1-1Q15270 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NKX1-1Q15270 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NKX1-1Q15270 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NKX1-1Q15270 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NKX1-1Q15270 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NKX1-1Q15270 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NKX1-1Q15270 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NKX1-1Q15270 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
NKX1-1Q15270 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NKX1-1Q15270 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NKX1-1Q15270 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NKX1-1Q15270 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NKX1-1Q15270 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NKX1-1Q15270 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NKX1-1Q15270 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NKX1-1Q15270 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NKX1-1Q15270 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NKX1-1Q15270 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NKX1-1Q15270 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NKX1-1Q15270 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
NKX1-1Q15270 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NKX1-1Q15270 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NKX1-1Q15270 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NKX1-1Q15270 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NKX1-1Q15270 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NKX1-1Q15270 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NKX1-1Q15270 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NKX1-1Q15270 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NKX1-1Q15270 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
NKX1-1Q15270 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NKX1-1Q15270 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
NKX1-1Q15270 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NKX1-1Q15270 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NKX1-1Q15270 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NKX1-1Q15270 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NKX1-1Q15270 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NKX1-1Q15270 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NKX1-1Q15270 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NKX1-1Q15270 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NKX1-1Q15270 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NKX1-1Q15270 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NKX1-1Q15270 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NKX1-1Q15270 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NKX1-1Q15270 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NKX1-1Q15270 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NKX1-1Q15270 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NKX1-1Q15270 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NKX1-1Q15270 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NKX1-1Q15270 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
NKX1-1Q15270 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
NKX1-1Q15270 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
NKX1-1Q15270 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
NKX1-1Q15270 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NKX1-1Q15270 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NKX1-1Q15270 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NKX1-1Q15270 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NKX1-1Q15270 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NKX1-1Q15270 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NKX1-1Q15270 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NKX1-1Q15270 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NKX1-1Q15270 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NKX1-1Q15270 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms