Protein–RNA interactions for Protein: Q15139

PRKD1, Serine/threonine-protein kinase D1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKD1Q15139 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PRKD1Q15139 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PRKD1Q15139 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PRKD1Q15139 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
PRKD1Q15139 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
PRKD1Q15139 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PRKD1Q15139 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PRKD1Q15139 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PRKD1Q15139 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PRKD1Q15139 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PRKD1Q15139 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PRKD1Q15139 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PRKD1Q15139 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PRKD1Q15139 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PRKD1Q15139 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PRKD1Q15139 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
PRKD1Q15139 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PRKD1Q15139 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PRKD1Q15139 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PRKD1Q15139 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PRKD1Q15139 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PRKD1Q15139 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PRKD1Q15139 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PRKD1Q15139 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PRKD1Q15139 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PRKD1Q15139 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PRKD1Q15139 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PRKD1Q15139 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PRKD1Q15139 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PRKD1Q15139 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PRKD1Q15139 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PRKD1Q15139 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PRKD1Q15139 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PRKD1Q15139 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PRKD1Q15139 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PRKD1Q15139 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PRKD1Q15139 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PRKD1Q15139 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PRKD1Q15139 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PRKD1Q15139 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PRKD1Q15139 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PRKD1Q15139 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PRKD1Q15139 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PRKD1Q15139 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PRKD1Q15139 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
PRKD1Q15139 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
PRKD1Q15139 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PRKD1Q15139 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PRKD1Q15139 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PRKD1Q15139 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PRKD1Q15139 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PRKD1Q15139 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PRKD1Q15139 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PRKD1Q15139 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PRKD1Q15139 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PRKD1Q15139 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PRKD1Q15139 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PRKD1Q15139 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PRKD1Q15139 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PRKD1Q15139 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PRKD1Q15139 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PRKD1Q15139 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PRKD1Q15139 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PRKD1Q15139 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PRKD1Q15139 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PRKD1Q15139 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PRKD1Q15139 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PRKD1Q15139 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PRKD1Q15139 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
PRKD1Q15139 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
PRKD1Q15139 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PRKD1Q15139 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PRKD1Q15139 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PRKD1Q15139 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PRKD1Q15139 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PRKD1Q15139 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PRKD1Q15139 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PRKD1Q15139 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PRKD1Q15139 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PRKD1Q15139 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PRKD1Q15139 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PRKD1Q15139 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PRKD1Q15139 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PRKD1Q15139 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PRKD1Q15139 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
PRKD1Q15139 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PRKD1Q15139 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
PRKD1Q15139 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PRKD1Q15139 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PRKD1Q15139 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
PRKD1Q15139 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PRKD1Q15139 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PRKD1Q15139 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PRKD1Q15139 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PRKD1Q15139 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PRKD1Q15139 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PRKD1Q15139 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PRKD1Q15139 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
PRKD1Q15139 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PRKD1Q15139 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
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