Protein–RNA interactions for Protein: Q15046

KARS, Lysine--tRNA ligase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 597 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KARSQ15046 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KARSQ15046 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KARSQ15046 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KARSQ15046 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KARSQ15046 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KARSQ15046 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KARSQ15046 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KARSQ15046 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KARSQ15046 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KARSQ15046 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KARSQ15046 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KARSQ15046 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KARSQ15046 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KARSQ15046 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KARSQ15046 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
KARSQ15046 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KARSQ15046 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KARSQ15046 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KARSQ15046 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KARSQ15046 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KARSQ15046 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KARSQ15046 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KARSQ15046 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KARSQ15046 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KARSQ15046 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KARSQ15046 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KARSQ15046 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KARSQ15046 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KARSQ15046 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KARSQ15046 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KARSQ15046 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KARSQ15046 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KARSQ15046 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
KARSQ15046 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KARSQ15046 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KARSQ15046 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KARSQ15046 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KARSQ15046 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KARSQ15046 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KARSQ15046 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KARSQ15046 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KARSQ15046 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KARSQ15046 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KARSQ15046 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KARSQ15046 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KARSQ15046 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KARSQ15046 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KARSQ15046 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
KARSQ15046 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
KARSQ15046 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KARSQ15046 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KARSQ15046 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KARSQ15046 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KARSQ15046 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KARSQ15046 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KARSQ15046 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KARSQ15046 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KARSQ15046 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KARSQ15046 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KARSQ15046 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KARSQ15046 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KARSQ15046 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KARSQ15046 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KARSQ15046 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KARSQ15046 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KARSQ15046 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
KARSQ15046 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KARSQ15046 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KARSQ15046 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KARSQ15046 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KARSQ15046 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KARSQ15046 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
KARSQ15046 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KARSQ15046 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KARSQ15046 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KARSQ15046 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KARSQ15046 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KARSQ15046 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KARSQ15046 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KARSQ15046 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KARSQ15046 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KARSQ15046 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KARSQ15046 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KARSQ15046 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KARSQ15046 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KARSQ15046 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KARSQ15046 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KARSQ15046 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KARSQ15046 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KARSQ15046 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KARSQ15046 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KARSQ15046 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
KARSQ15046 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KARSQ15046 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KARSQ15046 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
KARSQ15046 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KARSQ15046 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
KARSQ15046 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KARSQ15046 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KARSQ15046 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
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