Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

Predictions only

Length 1,050 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HERC3Q15034 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
HERC3Q15034 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HERC3Q15034 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HERC3Q15034 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
HERC3Q15034 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HERC3Q15034 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HERC3Q15034 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HERC3Q15034 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HERC3Q15034 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
HERC3Q15034 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HERC3Q15034 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HERC3Q15034 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HERC3Q15034 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HERC3Q15034 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HERC3Q15034 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HERC3Q15034 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HERC3Q15034 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HERC3Q15034 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HERC3Q15034 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HERC3Q15034 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HERC3Q15034 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HERC3Q15034 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HERC3Q15034 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HERC3Q15034 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HERC3Q15034 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HERC3Q15034 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HERC3Q15034 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
HERC3Q15034 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HERC3Q15034 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HERC3Q15034 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HERC3Q15034 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HERC3Q15034 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HERC3Q15034 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HERC3Q15034 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HERC3Q15034 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HERC3Q15034 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
HERC3Q15034 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HERC3Q15034 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HERC3Q15034 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HERC3Q15034 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HERC3Q15034 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HERC3Q15034 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HERC3Q15034 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HERC3Q15034 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HERC3Q15034 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HERC3Q15034 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HERC3Q15034 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HERC3Q15034 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HERC3Q15034 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HERC3Q15034 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HERC3Q15034 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HERC3Q15034 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HERC3Q15034 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HERC3Q15034 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HERC3Q15034 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HERC3Q15034 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HERC3Q15034 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HERC3Q15034 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HERC3Q15034 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HERC3Q15034 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HERC3Q15034 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HERC3Q15034 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HERC3Q15034 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HERC3Q15034 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HERC3Q15034 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HERC3Q15034 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HERC3Q15034 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HERC3Q15034 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HERC3Q15034 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HERC3Q15034 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HERC3Q15034 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HERC3Q15034 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HERC3Q15034 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HERC3Q15034 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HERC3Q15034 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HERC3Q15034 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HERC3Q15034 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HERC3Q15034 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HERC3Q15034 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HERC3Q15034 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HERC3Q15034 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HERC3Q15034 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HERC3Q15034 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HERC3Q15034 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HERC3Q15034 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HERC3Q15034 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HERC3Q15034 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HERC3Q15034 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HERC3Q15034 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HERC3Q15034 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HERC3Q15034 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HERC3Q15034 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HERC3Q15034 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HERC3Q15034 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HERC3Q15034 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HERC3Q15034 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HERC3Q15034 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HERC3Q15034 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HERC3Q15034 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms