Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

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Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GPNMBQ14956 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GPNMBQ14956 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GPNMBQ14956 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GPNMBQ14956 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GPNMBQ14956 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GPNMBQ14956 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GPNMBQ14956 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPNMBQ14956 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPNMBQ14956 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GPNMBQ14956 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPNMBQ14956 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPNMBQ14956 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPNMBQ14956 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPNMBQ14956 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPNMBQ14956 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPNMBQ14956 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPNMBQ14956 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPNMBQ14956 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPNMBQ14956 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPNMBQ14956 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPNMBQ14956 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPNMBQ14956 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPNMBQ14956 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPNMBQ14956 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPNMBQ14956 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPNMBQ14956 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPNMBQ14956 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPNMBQ14956 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPNMBQ14956 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPNMBQ14956 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPNMBQ14956 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPNMBQ14956 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPNMBQ14956 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPNMBQ14956 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPNMBQ14956 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPNMBQ14956 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GPNMBQ14956 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPNMBQ14956 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPNMBQ14956 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPNMBQ14956 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPNMBQ14956 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPNMBQ14956 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPNMBQ14956 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPNMBQ14956 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPNMBQ14956 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPNMBQ14956 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPNMBQ14956 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPNMBQ14956 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPNMBQ14956 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
GPNMBQ14956 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
GPNMBQ14956 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
GPNMBQ14956 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPNMBQ14956 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPNMBQ14956 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPNMBQ14956 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPNMBQ14956 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPNMBQ14956 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GPNMBQ14956 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPNMBQ14956 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPNMBQ14956 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPNMBQ14956 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPNMBQ14956 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPNMBQ14956 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPNMBQ14956 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GPNMBQ14956 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPNMBQ14956 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPNMBQ14956 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPNMBQ14956 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPNMBQ14956 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPNMBQ14956 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPNMBQ14956 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPNMBQ14956 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPNMBQ14956 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPNMBQ14956 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPNMBQ14956 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPNMBQ14956 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GPNMBQ14956 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GPNMBQ14956 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GPNMBQ14956 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GPNMBQ14956 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GPNMBQ14956 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GPNMBQ14956 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GPNMBQ14956 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GPNMBQ14956 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GPNMBQ14956 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GPNMBQ14956 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GPNMBQ14956 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GPNMBQ14956 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GPNMBQ14956 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GPNMBQ14956 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GPNMBQ14956 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GPNMBQ14956 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GPNMBQ14956 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GPNMBQ14956 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GPNMBQ14956 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GPNMBQ14956 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GPNMBQ14956 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GPNMBQ14956 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GPNMBQ14956 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
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