Protein–RNA interactions for Protein: Q14153

FAM53B, Protein FAM53B, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53BQ14153 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
FAM53BQ14153 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
FAM53BQ14153 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
FAM53BQ14153 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FAM53BQ14153 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
FAM53BQ14153 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FAM53BQ14153 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
FAM53BQ14153 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FAM53BQ14153 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FAM53BQ14153 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FAM53BQ14153 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
FAM53BQ14153 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FAM53BQ14153 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FAM53BQ14153 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
FAM53BQ14153 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FAM53BQ14153 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
FAM53BQ14153 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FAM53BQ14153 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
FAM53BQ14153 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FAM53BQ14153 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FAM53BQ14153 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
FAM53BQ14153 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FAM53BQ14153 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FAM53BQ14153 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
FAM53BQ14153 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FAM53BQ14153 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FAM53BQ14153 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
FAM53BQ14153 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FAM53BQ14153 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FAM53BQ14153 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FAM53BQ14153 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FAM53BQ14153 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FAM53BQ14153 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FAM53BQ14153 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FAM53BQ14153 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FAM53BQ14153 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
FAM53BQ14153 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
FAM53BQ14153 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
FAM53BQ14153 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
FAM53BQ14153 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
FAM53BQ14153 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FAM53BQ14153 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
FAM53BQ14153 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
FAM53BQ14153 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FAM53BQ14153 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FAM53BQ14153 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FAM53BQ14153 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
FAM53BQ14153 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
FAM53BQ14153 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
FAM53BQ14153 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
FAM53BQ14153 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
FAM53BQ14153 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
FAM53BQ14153 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
FAM53BQ14153 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
FAM53BQ14153 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
FAM53BQ14153 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
FAM53BQ14153 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
FAM53BQ14153 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
FAM53BQ14153 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
FAM53BQ14153 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
FAM53BQ14153 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
FAM53BQ14153 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
FAM53BQ14153 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
FAM53BQ14153 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
FAM53BQ14153 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
FAM53BQ14153 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
FAM53BQ14153 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
FAM53BQ14153 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
FAM53BQ14153 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
FAM53BQ14153 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
FAM53BQ14153 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
FAM53BQ14153 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
FAM53BQ14153 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FAM53BQ14153 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
FAM53BQ14153 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FAM53BQ14153 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FAM53BQ14153 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FAM53BQ14153 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FAM53BQ14153 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
FAM53BQ14153 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
FAM53BQ14153 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
FAM53BQ14153 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
FAM53BQ14153 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
FAM53BQ14153 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FAM53BQ14153 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FAM53BQ14153 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FAM53BQ14153 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FAM53BQ14153 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FAM53BQ14153 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FAM53BQ14153 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
FAM53BQ14153 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
FAM53BQ14153 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
FAM53BQ14153 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
FAM53BQ14153 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
FAM53BQ14153 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
FAM53BQ14153 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
FAM53BQ14153 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
FAM53BQ14153 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
FAM53BQ14153 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
FAM53BQ14153 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms