Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PEX6Q13608 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PEX6Q13608 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PEX6Q13608 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PEX6Q13608 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PEX6Q13608 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PEX6Q13608 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PEX6Q13608 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
PEX6Q13608 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PEX6Q13608 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PEX6Q13608 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PEX6Q13608 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PEX6Q13608 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PEX6Q13608 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
PEX6Q13608 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
PEX6Q13608 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PEX6Q13608 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PEX6Q13608 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PEX6Q13608 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PEX6Q13608 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PEX6Q13608 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PEX6Q13608 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
PEX6Q13608 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
PEX6Q13608 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PEX6Q13608 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PEX6Q13608 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PEX6Q13608 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PEX6Q13608 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PEX6Q13608 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PEX6Q13608 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PEX6Q13608 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PEX6Q13608 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PEX6Q13608 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PEX6Q13608 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PEX6Q13608 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PEX6Q13608 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PEX6Q13608 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PEX6Q13608 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PEX6Q13608 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
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PEX6Q13608 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
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PEX6Q13608 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PEX6Q13608 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
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PEX6Q13608 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PEX6Q13608 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PEX6Q13608 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PEX6Q13608 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PEX6Q13608 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
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PEX6Q13608 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PEX6Q13608 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
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PEX6Q13608 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
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PEX6Q13608 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PEX6Q13608 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
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PEX6Q13608 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PEX6Q13608 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PEX6Q13608 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
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PEX6Q13608 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
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PEX6Q13608 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PEX6Q13608 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PEX6Q13608 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PEX6Q13608 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PEX6Q13608 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PEX6Q13608 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PEX6Q13608 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PEX6Q13608 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PEX6Q13608 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PEX6Q13608 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PEX6Q13608 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PEX6Q13608 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PEX6Q13608 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PEX6Q13608 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PEX6Q13608 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PEX6Q13608 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PEX6Q13608 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
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