Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATRQ13535 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATRQ13535 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATRQ13535 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATRQ13535 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATRQ13535 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATRQ13535 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATRQ13535 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATRQ13535 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATRQ13535 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ATRQ13535 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATRQ13535 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ATRQ13535 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATRQ13535 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ATRQ13535 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ATRQ13535 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATRQ13535 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ATRQ13535 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATRQ13535 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATRQ13535 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATRQ13535 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATRQ13535 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATRQ13535 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATRQ13535 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATRQ13535 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATRQ13535 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATRQ13535 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATRQ13535 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATRQ13535 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATRQ13535 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATRQ13535 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATRQ13535 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATRQ13535 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATRQ13535 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATRQ13535 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATRQ13535 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATRQ13535 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATRQ13535 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATRQ13535 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATRQ13535 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATRQ13535 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATRQ13535 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ATRQ13535 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATRQ13535 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ATRQ13535 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ATRQ13535 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATRQ13535 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATRQ13535 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATRQ13535 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ATRQ13535 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATRQ13535 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATRQ13535 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATRQ13535 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATRQ13535 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATRQ13535 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATRQ13535 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATRQ13535 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATRQ13535 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ATRQ13535 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATRQ13535 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATRQ13535 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATRQ13535 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATRQ13535 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATRQ13535 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATRQ13535 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATRQ13535 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATRQ13535 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATRQ13535 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATRQ13535 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATRQ13535 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATRQ13535 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATRQ13535 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATRQ13535 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATRQ13535 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATRQ13535 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATRQ13535 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ATRQ13535 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATRQ13535 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATRQ13535 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATRQ13535 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATRQ13535 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATRQ13535 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATRQ13535 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATRQ13535 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATRQ13535 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATRQ13535 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATRQ13535 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATRQ13535 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATRQ13535 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATRQ13535 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATRQ13535 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATRQ13535 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATRQ13535 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATRQ13535 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATRQ13535 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATRQ13535 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATRQ13535 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
ATRQ13535 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATRQ13535 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATRQ13535 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
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