Protein–RNA interactions for Protein: Q13523

PRPF4B, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4BQ13523 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRPF4BQ13523 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRPF4BQ13523 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRPF4BQ13523 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRPF4BQ13523 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRPF4BQ13523 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRPF4BQ13523 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRPF4BQ13523 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PRPF4BQ13523 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PRPF4BQ13523 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRPF4BQ13523 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRPF4BQ13523 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRPF4BQ13523 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRPF4BQ13523 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRPF4BQ13523 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRPF4BQ13523 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRPF4BQ13523 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRPF4BQ13523 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRPF4BQ13523 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRPF4BQ13523 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRPF4BQ13523 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRPF4BQ13523 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRPF4BQ13523 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRPF4BQ13523 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRPF4BQ13523 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRPF4BQ13523 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRPF4BQ13523 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRPF4BQ13523 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRPF4BQ13523 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRPF4BQ13523 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRPF4BQ13523 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRPF4BQ13523 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRPF4BQ13523 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRPF4BQ13523 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRPF4BQ13523 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRPF4BQ13523 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRPF4BQ13523 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRPF4BQ13523 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRPF4BQ13523 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRPF4BQ13523 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRPF4BQ13523 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRPF4BQ13523 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRPF4BQ13523 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRPF4BQ13523 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRPF4BQ13523 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRPF4BQ13523 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PRPF4BQ13523 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRPF4BQ13523 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRPF4BQ13523 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRPF4BQ13523 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRPF4BQ13523 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PRPF4BQ13523 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PRPF4BQ13523 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRPF4BQ13523 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRPF4BQ13523 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRPF4BQ13523 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRPF4BQ13523 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRPF4BQ13523 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PRPF4BQ13523 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRPF4BQ13523 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRPF4BQ13523 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRPF4BQ13523 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRPF4BQ13523 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRPF4BQ13523 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRPF4BQ13523 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRPF4BQ13523 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRPF4BQ13523 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRPF4BQ13523 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRPF4BQ13523 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRPF4BQ13523 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRPF4BQ13523 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRPF4BQ13523 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRPF4BQ13523 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRPF4BQ13523 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRPF4BQ13523 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRPF4BQ13523 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRPF4BQ13523 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRPF4BQ13523 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PRPF4BQ13523 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRPF4BQ13523 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRPF4BQ13523 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRPF4BQ13523 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRPF4BQ13523 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRPF4BQ13523 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRPF4BQ13523 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PRPF4BQ13523 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRPF4BQ13523 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRPF4BQ13523 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRPF4BQ13523 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRPF4BQ13523 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRPF4BQ13523 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRPF4BQ13523 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRPF4BQ13523 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRPF4BQ13523 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRPF4BQ13523 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PRPF4BQ13523 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRPF4BQ13523 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRPF4BQ13523 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRPF4BQ13523 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRPF4BQ13523 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
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