Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LSAMPQ13449 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LSAMPQ13449 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LSAMPQ13449 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
LSAMPQ13449 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LSAMPQ13449 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LSAMPQ13449 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LSAMPQ13449 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LSAMPQ13449 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LSAMPQ13449 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LSAMPQ13449 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LSAMPQ13449 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LSAMPQ13449 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LSAMPQ13449 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LSAMPQ13449 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LSAMPQ13449 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LSAMPQ13449 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LSAMPQ13449 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LSAMPQ13449 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
LSAMPQ13449 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
LSAMPQ13449 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
LSAMPQ13449 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
LSAMPQ13449 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
LSAMPQ13449 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
LSAMPQ13449 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LSAMPQ13449 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LSAMPQ13449 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LSAMPQ13449 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LSAMPQ13449 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LSAMPQ13449 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LSAMPQ13449 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LSAMPQ13449 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LSAMPQ13449 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
LSAMPQ13449 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LSAMPQ13449 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LSAMPQ13449 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LSAMPQ13449 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LSAMPQ13449 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LSAMPQ13449 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LSAMPQ13449 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LSAMPQ13449 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LSAMPQ13449 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LSAMPQ13449 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LSAMPQ13449 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LSAMPQ13449 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LSAMPQ13449 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LSAMPQ13449 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LSAMPQ13449 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LSAMPQ13449 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LSAMPQ13449 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LSAMPQ13449 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LSAMPQ13449 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LSAMPQ13449 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LSAMPQ13449 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LSAMPQ13449 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LSAMPQ13449 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LSAMPQ13449 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LSAMPQ13449 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LSAMPQ13449 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LSAMPQ13449 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
LSAMPQ13449 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LSAMPQ13449 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LSAMPQ13449 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LSAMPQ13449 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
LSAMPQ13449 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LSAMPQ13449 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LSAMPQ13449 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LSAMPQ13449 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LSAMPQ13449 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LSAMPQ13449 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LSAMPQ13449 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LSAMPQ13449 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LSAMPQ13449 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LSAMPQ13449 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LSAMPQ13449 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LSAMPQ13449 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LSAMPQ13449 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LSAMPQ13449 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LSAMPQ13449 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LSAMPQ13449 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LSAMPQ13449 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LSAMPQ13449 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LSAMPQ13449 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LSAMPQ13449 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LSAMPQ13449 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LSAMPQ13449 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LSAMPQ13449 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
LSAMPQ13449 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LSAMPQ13449 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LSAMPQ13449 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LSAMPQ13449 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LSAMPQ13449 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LSAMPQ13449 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LSAMPQ13449 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LSAMPQ13449 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LSAMPQ13449 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LSAMPQ13449 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LSAMPQ13449 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LSAMPQ13449 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LSAMPQ13449 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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