Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MKRN4PQ13434 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MKRN4PQ13434 ARL4AP4-201ENST00000434170 518 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
MKRN4PQ13434 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MKRN4PQ13434 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MKRN4PQ13434 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MKRN4PQ13434 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MKRN4PQ13434 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MKRN4PQ13434 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MKRN4PQ13434 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MKRN4PQ13434 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MKRN4PQ13434 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MKRN4PQ13434 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MKRN4PQ13434 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MKRN4PQ13434 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MKRN4PQ13434 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MKRN4PQ13434 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MKRN4PQ13434 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MKRN4PQ13434 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MKRN4PQ13434 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MKRN4PQ13434 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MKRN4PQ13434 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MKRN4PQ13434 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MKRN4PQ13434 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MKRN4PQ13434 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MKRN4PQ13434 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MKRN4PQ13434 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MKRN4PQ13434 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MKRN4PQ13434 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MKRN4PQ13434 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
MKRN4PQ13434 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MKRN4PQ13434 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
MKRN4PQ13434 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MKRN4PQ13434 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MKRN4PQ13434 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MKRN4PQ13434 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MKRN4PQ13434 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MKRN4PQ13434 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MKRN4PQ13434 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MKRN4PQ13434 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
MKRN4PQ13434 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MKRN4PQ13434 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MKRN4PQ13434 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MKRN4PQ13434 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MKRN4PQ13434 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
MKRN4PQ13434 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MKRN4PQ13434 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MKRN4PQ13434 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MKRN4PQ13434 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MKRN4PQ13434 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MKRN4PQ13434 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MKRN4PQ13434 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
MKRN4PQ13434 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MKRN4PQ13434 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
MKRN4PQ13434 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MKRN4PQ13434 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MKRN4PQ13434 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MKRN4PQ13434 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MKRN4PQ13434 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MKRN4PQ13434 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MKRN4PQ13434 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MKRN4PQ13434 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MKRN4PQ13434 MIR3908-201ENST00000579798 126 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
MKRN4PQ13434 AC137695.1-201ENST00000604126 489 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
MKRN4PQ13434 AL031670.1-201ENST00000619343 669 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MKRN4PQ13434 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MKRN4PQ13434 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MKRN4PQ13434 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MKRN4PQ13434 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MKRN4PQ13434 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
MKRN4PQ13434 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
MKRN4PQ13434 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MKRN4PQ13434 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MKRN4PQ13434 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MKRN4PQ13434 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MKRN4PQ13434 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MKRN4PQ13434 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
MKRN4PQ13434 AL161757.2-201ENST00000553800 421 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MKRN4PQ13434 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MKRN4PQ13434 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MKRN4PQ13434 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MKRN4PQ13434 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MKRN4PQ13434 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MKRN4PQ13434 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MKRN4PQ13434 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
MKRN4PQ13434 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MKRN4PQ13434 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MKRN4PQ13434 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MKRN4PQ13434 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MKRN4PQ13434 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MKRN4PQ13434 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MKRN4PQ13434 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MKRN4PQ13434 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MKRN4PQ13434 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MKRN4PQ13434 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
MKRN4PQ13434 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MKRN4PQ13434 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MKRN4PQ13434 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MKRN4PQ13434 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MKRN4PQ13434 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
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