Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
XRCC4Q13426 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
XRCC4Q13426 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
XRCC4Q13426 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
XRCC4Q13426 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
XRCC4Q13426 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
XRCC4Q13426 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
XRCC4Q13426 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
XRCC4Q13426 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
XRCC4Q13426 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
XRCC4Q13426 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
XRCC4Q13426 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
XRCC4Q13426 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
XRCC4Q13426 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
XRCC4Q13426 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
XRCC4Q13426 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
XRCC4Q13426 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
XRCC4Q13426 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
XRCC4Q13426 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
XRCC4Q13426 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
XRCC4Q13426 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
XRCC4Q13426 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
XRCC4Q13426 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
XRCC4Q13426 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
XRCC4Q13426 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
XRCC4Q13426 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
XRCC4Q13426 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
XRCC4Q13426 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
XRCC4Q13426 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
XRCC4Q13426 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
XRCC4Q13426 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
XRCC4Q13426 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
XRCC4Q13426 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
XRCC4Q13426 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
XRCC4Q13426 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
XRCC4Q13426 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
XRCC4Q13426 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
XRCC4Q13426 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
XRCC4Q13426 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
XRCC4Q13426 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
XRCC4Q13426 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
XRCC4Q13426 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
XRCC4Q13426 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
XRCC4Q13426 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
XRCC4Q13426 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
XRCC4Q13426 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
XRCC4Q13426 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
XRCC4Q13426 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
XRCC4Q13426 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
XRCC4Q13426 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
XRCC4Q13426 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
XRCC4Q13426 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
XRCC4Q13426 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
XRCC4Q13426 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
XRCC4Q13426 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
XRCC4Q13426 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
XRCC4Q13426 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
XRCC4Q13426 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
XRCC4Q13426 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
XRCC4Q13426 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
XRCC4Q13426 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
XRCC4Q13426 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
XRCC4Q13426 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
XRCC4Q13426 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
XRCC4Q13426 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
XRCC4Q13426 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
XRCC4Q13426 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
XRCC4Q13426 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
XRCC4Q13426 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
XRCC4Q13426 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
XRCC4Q13426 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
XRCC4Q13426 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
XRCC4Q13426 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
XRCC4Q13426 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
XRCC4Q13426 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
XRCC4Q13426 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
XRCC4Q13426 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
XRCC4Q13426 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
XRCC4Q13426 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
XRCC4Q13426 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
XRCC4Q13426 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
XRCC4Q13426 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
XRCC4Q13426 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
XRCC4Q13426 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
XRCC4Q13426 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
XRCC4Q13426 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
XRCC4Q13426 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
XRCC4Q13426 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
XRCC4Q13426 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
XRCC4Q13426 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
XRCC4Q13426 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
XRCC4Q13426 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
XRCC4Q13426 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
XRCC4Q13426 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
XRCC4Q13426 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
XRCC4Q13426 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
XRCC4Q13426 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
XRCC4Q13426 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
XRCC4Q13426 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
XRCC4Q13426 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
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