Protein–RNA interactions for Protein: Q13424

SNTA1, Alpha-1-syntrophin, humanhuman

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Length 505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTA1Q13424 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SNTA1Q13424 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SNTA1Q13424 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SNTA1Q13424 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SNTA1Q13424 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
SNTA1Q13424 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SNTA1Q13424 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SNTA1Q13424 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SNTA1Q13424 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SNTA1Q13424 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SNTA1Q13424 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SNTA1Q13424 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SNTA1Q13424 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SNTA1Q13424 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SNTA1Q13424 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SNTA1Q13424 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SNTA1Q13424 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SNTA1Q13424 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SNTA1Q13424 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SNTA1Q13424 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SNTA1Q13424 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SNTA1Q13424 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SNTA1Q13424 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
SNTA1Q13424 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SNTA1Q13424 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SNTA1Q13424 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SNTA1Q13424 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SNTA1Q13424 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SNTA1Q13424 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SNTA1Q13424 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SNTA1Q13424 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SNTA1Q13424 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SNTA1Q13424 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SNTA1Q13424 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SNTA1Q13424 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SNTA1Q13424 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SNTA1Q13424 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SNTA1Q13424 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SNTA1Q13424 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
SNTA1Q13424 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SNTA1Q13424 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SNTA1Q13424 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SNTA1Q13424 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SNTA1Q13424 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
SNTA1Q13424 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SNTA1Q13424 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SNTA1Q13424 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
SNTA1Q13424 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SNTA1Q13424 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SNTA1Q13424 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SNTA1Q13424 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SNTA1Q13424 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SNTA1Q13424 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SNTA1Q13424 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SNTA1Q13424 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SNTA1Q13424 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SNTA1Q13424 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SNTA1Q13424 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SNTA1Q13424 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SNTA1Q13424 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SNTA1Q13424 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SNTA1Q13424 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SNTA1Q13424 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SNTA1Q13424 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SNTA1Q13424 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SNTA1Q13424 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SNTA1Q13424 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SNTA1Q13424 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SNTA1Q13424 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SNTA1Q13424 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SNTA1Q13424 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SNTA1Q13424 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SNTA1Q13424 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SNTA1Q13424 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SNTA1Q13424 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SNTA1Q13424 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SNTA1Q13424 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SNTA1Q13424 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
SNTA1Q13424 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
SNTA1Q13424 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
SNTA1Q13424 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SNTA1Q13424 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SNTA1Q13424 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SNTA1Q13424 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SNTA1Q13424 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SNTA1Q13424 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SNTA1Q13424 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SNTA1Q13424 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SNTA1Q13424 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SNTA1Q13424 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SNTA1Q13424 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SNTA1Q13424 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SNTA1Q13424 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SNTA1Q13424 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SNTA1Q13424 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SNTA1Q13424 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SNTA1Q13424 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SNTA1Q13424 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SNTA1Q13424 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SNTA1Q13424 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
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