Protein–RNA interactions for Protein: Q13296

SCGB2A2, Mammaglobin-A, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB2A2Q13296 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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SCGB2A2Q13296 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCGB2A2Q13296 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCGB2A2Q13296 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCGB2A2Q13296 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCGB2A2Q13296 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCGB2A2Q13296 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCGB2A2Q13296 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCGB2A2Q13296 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCGB2A2Q13296 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCGB2A2Q13296 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCGB2A2Q13296 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCGB2A2Q13296 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SCGB2A2Q13296 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCGB2A2Q13296 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCGB2A2Q13296 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCGB2A2Q13296 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SCGB2A2Q13296 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCGB2A2Q13296 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCGB2A2Q13296 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCGB2A2Q13296 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCGB2A2Q13296 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCGB2A2Q13296 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SCGB2A2Q13296 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCGB2A2Q13296 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCGB2A2Q13296 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCGB2A2Q13296 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCGB2A2Q13296 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCGB2A2Q13296 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SCGB2A2Q13296 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SCGB2A2Q13296 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SCGB2A2Q13296 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SCGB2A2Q13296 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SCGB2A2Q13296 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SCGB2A2Q13296 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SCGB2A2Q13296 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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SCGB2A2Q13296 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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SCGB2A2Q13296 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SCGB2A2Q13296 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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SCGB2A2Q13296 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SCGB2A2Q13296 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SCGB2A2Q13296 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
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SCGB2A2Q13296 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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SCGB2A2Q13296 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
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SCGB2A2Q13296 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SCGB2A2Q13296 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SCGB2A2Q13296 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SCGB2A2Q13296 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SCGB2A2Q13296 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SCGB2A2Q13296 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SCGB2A2Q13296 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SCGB2A2Q13296 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SCGB2A2Q13296 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SCGB2A2Q13296 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SCGB2A2Q13296 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SCGB2A2Q13296 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SCGB2A2Q13296 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SCGB2A2Q13296 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SCGB2A2Q13296 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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