Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CLN3Q13286 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CLN3Q13286 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CLN3Q13286 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CLN3Q13286 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CLN3Q13286 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CLN3Q13286 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CLN3Q13286 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CLN3Q13286 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CLN3Q13286 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CLN3Q13286 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CLN3Q13286 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CLN3Q13286 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CLN3Q13286 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CLN3Q13286 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CLN3Q13286 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CLN3Q13286 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CLN3Q13286 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CLN3Q13286 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CLN3Q13286 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CLN3Q13286 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CLN3Q13286 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CLN3Q13286 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CLN3Q13286 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CLN3Q13286 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CLN3Q13286 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CLN3Q13286 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CLN3Q13286 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CLN3Q13286 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CLN3Q13286 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CLN3Q13286 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CLN3Q13286 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CLN3Q13286 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CLN3Q13286 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CLN3Q13286 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CLN3Q13286 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CLN3Q13286 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CLN3Q13286 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CLN3Q13286 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CLN3Q13286 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CLN3Q13286 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CLN3Q13286 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CLN3Q13286 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CLN3Q13286 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CLN3Q13286 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CLN3Q13286 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CLN3Q13286 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CLN3Q13286 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CLN3Q13286 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CLN3Q13286 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CLN3Q13286 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CLN3Q13286 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CLN3Q13286 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CLN3Q13286 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CLN3Q13286 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CLN3Q13286 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CLN3Q13286 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CLN3Q13286 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CLN3Q13286 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CLN3Q13286 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CLN3Q13286 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CLN3Q13286 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CLN3Q13286 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CLN3Q13286 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CLN3Q13286 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CLN3Q13286 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CLN3Q13286 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CLN3Q13286 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CLN3Q13286 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CLN3Q13286 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CLN3Q13286 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CLN3Q13286 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CLN3Q13286 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CLN3Q13286 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CLN3Q13286 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CLN3Q13286 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CLN3Q13286 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CLN3Q13286 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CLN3Q13286 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CLN3Q13286 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CLN3Q13286 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CLN3Q13286 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CLN3Q13286 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CLN3Q13286 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CLN3Q13286 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CLN3Q13286 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CLN3Q13286 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CLN3Q13286 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CLN3Q13286 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CLN3Q13286 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CLN3Q13286 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CLN3Q13286 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CLN3Q13286 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CLN3Q13286 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CLN3Q13286 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CLN3Q13286 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CLN3Q13286 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CLN3Q13286 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CLN3Q13286 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CLN3Q13286 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms