Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

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Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DUSP4Q13115 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DUSP4Q13115 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DUSP4Q13115 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DUSP4Q13115 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DUSP4Q13115 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DUSP4Q13115 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
DUSP4Q13115 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DUSP4Q13115 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DUSP4Q13115 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DUSP4Q13115 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DUSP4Q13115 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DUSP4Q13115 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DUSP4Q13115 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DUSP4Q13115 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DUSP4Q13115 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DUSP4Q13115 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DUSP4Q13115 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DUSP4Q13115 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DUSP4Q13115 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
DUSP4Q13115 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DUSP4Q13115 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DUSP4Q13115 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DUSP4Q13115 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DUSP4Q13115 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DUSP4Q13115 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DUSP4Q13115 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DUSP4Q13115 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DUSP4Q13115 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DUSP4Q13115 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DUSP4Q13115 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DUSP4Q13115 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DUSP4Q13115 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DUSP4Q13115 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
DUSP4Q13115 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
DUSP4Q13115 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
DUSP4Q13115 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
DUSP4Q13115 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
DUSP4Q13115 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
DUSP4Q13115 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DUSP4Q13115 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DUSP4Q13115 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DUSP4Q13115 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DUSP4Q13115 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DUSP4Q13115 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DUSP4Q13115 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DUSP4Q13115 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DUSP4Q13115 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DUSP4Q13115 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DUSP4Q13115 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
DUSP4Q13115 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DUSP4Q13115 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DUSP4Q13115 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DUSP4Q13115 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DUSP4Q13115 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DUSP4Q13115 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
DUSP4Q13115 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DUSP4Q13115 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DUSP4Q13115 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DUSP4Q13115 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DUSP4Q13115 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DUSP4Q13115 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DUSP4Q13115 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DUSP4Q13115 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DUSP4Q13115 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DUSP4Q13115 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DUSP4Q13115 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DUSP4Q13115 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DUSP4Q13115 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DUSP4Q13115 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DUSP4Q13115 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
DUSP4Q13115 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DUSP4Q13115 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DUSP4Q13115 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DUSP4Q13115 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DUSP4Q13115 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DUSP4Q13115 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DUSP4Q13115 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DUSP4Q13115 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DUSP4Q13115 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DUSP4Q13115 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DUSP4Q13115 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DUSP4Q13115 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DUSP4Q13115 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DUSP4Q13115 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DUSP4Q13115 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DUSP4Q13115 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DUSP4Q13115 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DUSP4Q13115 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DUSP4Q13115 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DUSP4Q13115 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DUSP4Q13115 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DUSP4Q13115 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DUSP4Q13115 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DUSP4Q13115 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DUSP4Q13115 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
DUSP4Q13115 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DUSP4Q13115 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DUSP4Q13115 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DUSP4Q13115 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
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