Protein–RNA interactions for Protein: Q13061

TRDN, Triadin, humanhuman

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Length 729 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDNQ13061 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRDNQ13061 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRDNQ13061 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TRDNQ13061 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRDNQ13061 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRDNQ13061 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRDNQ13061 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRDNQ13061 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRDNQ13061 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TRDNQ13061 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TRDNQ13061 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TRDNQ13061 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRDNQ13061 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRDNQ13061 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRDNQ13061 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRDNQ13061 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRDNQ13061 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRDNQ13061 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TRDNQ13061 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TRDNQ13061 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRDNQ13061 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRDNQ13061 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TRDNQ13061 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRDNQ13061 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRDNQ13061 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRDNQ13061 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRDNQ13061 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRDNQ13061 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRDNQ13061 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRDNQ13061 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRDNQ13061 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRDNQ13061 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRDNQ13061 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRDNQ13061 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRDNQ13061 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TRDNQ13061 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TRDNQ13061 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TRDNQ13061 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRDNQ13061 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRDNQ13061 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRDNQ13061 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRDNQ13061 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRDNQ13061 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRDNQ13061 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRDNQ13061 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRDNQ13061 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRDNQ13061 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRDNQ13061 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRDNQ13061 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRDNQ13061 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRDNQ13061 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRDNQ13061 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRDNQ13061 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRDNQ13061 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRDNQ13061 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRDNQ13061 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRDNQ13061 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRDNQ13061 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRDNQ13061 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRDNQ13061 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRDNQ13061 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRDNQ13061 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRDNQ13061 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TRDNQ13061 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRDNQ13061 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRDNQ13061 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRDNQ13061 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRDNQ13061 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRDNQ13061 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRDNQ13061 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRDNQ13061 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRDNQ13061 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRDNQ13061 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRDNQ13061 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRDNQ13061 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRDNQ13061 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRDNQ13061 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRDNQ13061 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRDNQ13061 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRDNQ13061 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRDNQ13061 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRDNQ13061 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRDNQ13061 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRDNQ13061 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRDNQ13061 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRDNQ13061 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRDNQ13061 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRDNQ13061 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRDNQ13061 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TRDNQ13061 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRDNQ13061 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRDNQ13061 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRDNQ13061 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRDNQ13061 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRDNQ13061 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRDNQ13061 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRDNQ13061 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRDNQ13061 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRDNQ13061 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRDNQ13061 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
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