Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FOXF2Q12947 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FOXF2Q12947 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FOXF2Q12947 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FOXF2Q12947 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FOXF2Q12947 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FOXF2Q12947 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FOXF2Q12947 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FOXF2Q12947 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FOXF2Q12947 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FOXF2Q12947 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FOXF2Q12947 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FOXF2Q12947 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FOXF2Q12947 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
FOXF2Q12947 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FOXF2Q12947 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FOXF2Q12947 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FOXF2Q12947 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FOXF2Q12947 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FOXF2Q12947 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FOXF2Q12947 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FOXF2Q12947 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FOXF2Q12947 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FOXF2Q12947 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FOXF2Q12947 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FOXF2Q12947 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
FOXF2Q12947 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FOXF2Q12947 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FOXF2Q12947 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FOXF2Q12947 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FOXF2Q12947 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FOXF2Q12947 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FOXF2Q12947 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FOXF2Q12947 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FOXF2Q12947 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FOXF2Q12947 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FOXF2Q12947 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FOXF2Q12947 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FOXF2Q12947 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FOXF2Q12947 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FOXF2Q12947 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FOXF2Q12947 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FOXF2Q12947 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FOXF2Q12947 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FOXF2Q12947 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FOXF2Q12947 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FOXF2Q12947 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FOXF2Q12947 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
FOXF2Q12947 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FOXF2Q12947 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FOXF2Q12947 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FOXF2Q12947 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
FOXF2Q12947 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FOXF2Q12947 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FOXF2Q12947 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FOXF2Q12947 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FOXF2Q12947 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FOXF2Q12947 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FOXF2Q12947 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FOXF2Q12947 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FOXF2Q12947 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FOXF2Q12947 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FOXF2Q12947 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FOXF2Q12947 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FOXF2Q12947 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FOXF2Q12947 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FOXF2Q12947 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FOXF2Q12947 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FOXF2Q12947 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FOXF2Q12947 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FOXF2Q12947 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FOXF2Q12947 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FOXF2Q12947 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FOXF2Q12947 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FOXF2Q12947 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FOXF2Q12947 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FOXF2Q12947 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FOXF2Q12947 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FOXF2Q12947 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FOXF2Q12947 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FOXF2Q12947 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FOXF2Q12947 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FOXF2Q12947 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FOXF2Q12947 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FOXF2Q12947 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FOXF2Q12947 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FOXF2Q12947 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FOXF2Q12947 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FOXF2Q12947 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FOXF2Q12947 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FOXF2Q12947 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FOXF2Q12947 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FOXF2Q12947 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FOXF2Q12947 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FOXF2Q12947 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FOXF2Q12947 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FOXF2Q12947 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FOXF2Q12947 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FOXF2Q12947 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FOXF2Q12947 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms