Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
TROQ12816 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
TROQ12816 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
TROQ12816 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
TROQ12816 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
TROQ12816 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
TROQ12816 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
TROQ12816 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
TROQ12816 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
TROQ12816 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
TROQ12816 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
TROQ12816 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
TROQ12816 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
TROQ12816 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
TROQ12816 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
TROQ12816 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
TROQ12816 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
TROQ12816 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.4■■■□□ 2.62
TROQ12816 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
TROQ12816 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC31.4■■■□□ 2.62
TROQ12816 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC31.4■■■□□ 2.62
TROQ12816 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
TROQ12816 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
TROQ12816 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
TROQ12816 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
TROQ12816 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
TROQ12816 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
TROQ12816 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
TROQ12816 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
TROQ12816 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
TROQ12816 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
TROQ12816 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
TROQ12816 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
TROQ12816 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC31.39■■■□□ 2.62
TROQ12816 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
TROQ12816 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.61
TROQ12816 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC31.38■■■□□ 2.61
TROQ12816 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
TROQ12816 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
TROQ12816 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
TROQ12816 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
TROQ12816 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC31.38■■■□□ 2.61
TROQ12816 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
TROQ12816 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
TROQ12816 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
TROQ12816 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
TROQ12816 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
TROQ12816 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC31.37■■■□□ 2.61
TROQ12816 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
TROQ12816 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
TROQ12816 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
TROQ12816 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
TROQ12816 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
TROQ12816 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
TROQ12816 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
TROQ12816 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
TROQ12816 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
TROQ12816 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
TROQ12816 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
TROQ12816 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
TROQ12816 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
TROQ12816 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
TROQ12816 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
TROQ12816 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
TROQ12816 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
TROQ12816 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC31.36■■■□□ 2.61
TROQ12816 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC31.36■■■□□ 2.61
TROQ12816 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
TROQ12816 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
TROQ12816 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC31.36■■■□□ 2.61
TROQ12816 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
TROQ12816 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
TROQ12816 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
TROQ12816 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
TROQ12816 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC31.35■■■□□ 2.61
TROQ12816 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
TROQ12816 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC31.35■■■□□ 2.61
TROQ12816 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
TROQ12816 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
TROQ12816 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC31.35■■■□□ 2.61
TROQ12816 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC31.35■■■□□ 2.61
TROQ12816 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
TROQ12816 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
TROQ12816 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
TROQ12816 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
TROQ12816 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
TROQ12816 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
TROQ12816 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC31.34■■■□□ 2.61
TROQ12816 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC31.34■■■□□ 2.61
TROQ12816 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
TROQ12816 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
TROQ12816 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
TROQ12816 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
TROQ12816 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
TROQ12816 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
TROQ12816 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
TROQ12816 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
TROQ12816 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC31.33■■■□□ 2.61
TROQ12816 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
TROQ12816 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC31.33■■■□□ 2.61
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