Protein–RNA interactions for Protein: Q12460

NOP56, Nucleolar protein 56, yeastyeast

Known RBP RIP-Chip data

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NOP56Q12460 SNC2YOR327C 348 nt2.62□□□□□ -1.99
NOP56Q12460 YBR121C-AYBR121C-A 159 nt2.62□□□□□ -1.99
NOP56Q12460 VMA9YCL005W-A 222 nt2.62□□□□□ -1.99
NOP56Q12460 KAP123YER110C 3342 nt2.62□□□□□ -1.99
NOP56Q12460 TCB2YNL087W 3537 nt2.62□□□□□ -1.99
NOP56Q12460 RTT10YPL183C 3042 nt2.61□□□□□ -1.99
NOP56Q12460 RRP6YOR001W 2202 nt2.61□□□□□ -1.99
NOP56Q12460 YEL043WYEL043W 2871 nt2.61□□□□□ -1.99 RIP-Chip
NOP56Q12460 QCR7YDR529C 384 nt2.61□□□□□ -1.99
NOP56Q12460 YGL239CYGL239C 315 nt2.61□□□□□ -1.99
NOP56Q12460 NOP10YHR072W-A 177 nt2.61□□□□□ -1.99
NOP56Q12460 PGA1YNL158W 597 nt2.61□□□□□ -1.99
NOP56Q12460 YOR199WYOR199W 330 nt2.61□□□□□ -1.99
NOP56Q12460 WIP1YDR374W-A 270 nt2.6□□□□□ -1.99
NOP56Q12460 HMF1YER057C 390 nt2.6□□□□□ -1.99
NOP56Q12460 RPL26AYLR344W 384 nt2.6□□□□□ -1.99
NOP56Q12460 ISF1YMR081C 1017 nt2.6□□□□□ -1.99
NOP56Q12460 IRC23YOR044W 474 nt2.6□□□□□ -1.99
NOP56Q12460 VPS35YJL154C 2835 nt2.6□□□□□ -1.99 RIP-Chip
NOP56Q12460 MDM1YML104C 3384 nt2.6□□□□□ -1.99
NOP56Q12460 YNL018CYNL018C 1839 nt2.6□□□□□ -1.99
NOP56Q12460 MRD1YPR112C 2664 nt2.6□□□□□ -1.99
NOP56Q12460 CDC50YCR094W 1176 nt2.59□□□□□ -1.99
NOP56Q12460 YIL066W-AYIL066W-A 444 nt2.59□□□□□ -1.99
NOP56Q12460 YKR033CYKR033C 426 nt2.59□□□□□ -1.99
NOP56Q12460 YAF9YNL107W 681 nt2.59□□□□□ -1.99
NOP56Q12460 HEH2YDR458C 1992 nt2.59□□□□□ -2
NOP56Q12460 DOT6YER088C 2013 nt2.59□□□□□ -2
NOP56Q12460 CBF2YGR140W 2871 nt2.59□□□□□ -2
NOP56Q12460 YRB1YDR002W 606 nt2.58□□□□□ -2
NOP56Q12460 DAD4YDR320C-A 219 nt2.58□□□□□ -2
NOP56Q12460 RPS24AYER074W 408 nt2.58□□□□□ -2
NOP56Q12460 AFI1YOR129C 2682 nt2.58□□□□□ -2
NOP56Q12460 STH1YIL126W 4080 nt2.58□□□□□ -2 RIP-Chip
NOP56Q12460 SWA2YDR320C 2007 nt2.58□□□□□ -2
NOP56Q12460 NMD2YHR077C 3270 nt2.57□□□□□ -2
NOP56Q12460 AIM9YER080W 1884 nt2.57□□□□□ -2
NOP56Q12460 YGL063C-AYGL063C-A 150 nt2.57□□□□□ -2
NOP56Q12460 YGR174W-AYGR174W-A 87 nt2.57□□□□□ -2
NOP56Q12460 TIM13YGR181W 318 nt2.57□□□□□ -2
NOP56Q12460 YJL020W-AYJL020W-A 258 nt2.57□□□□□ -2
NOP56Q12460 YKL083WYKL083W 615 nt2.57□□□□□ -2
NOP56Q12460 YBL073WYBL073W 312 nt2.57□□□□□ -2
NOP56Q12460 UBP15YMR304W 3693 nt2.56□□□□□ -2
NOP56Q12460 YIL080WYIL080W 4722 nt2.55□□□□□ -2
NOP56Q12460 tF(GAA)DtF(GAA)D 73 nt2.55□□□□□ -2
NOP56Q12460 tF(GAA)NtF(GAA)N 73 nt2.55□□□□□ -2
NOP56Q12460 TWF1YGR080W 999 nt2.55□□□□□ -2
NOP56Q12460 RPL14BYHL001W 417 nt2.55□□□□□ -2
NOP56Q12460 YHL037CYHL037C 402 nt2.55□□□□□ -2
NOP56Q12460 tW(UCA)QtW(UCA)Q 74 nt2.55□□□□□ -2
NOP56Q12460 RIC1YLR039C 3171 nt2.55□□□□□ -2
NOP56Q12460 TIM18YOR297C 579 nt2.55□□□□□ -2
NOP56Q12460 RPL33AYPL143W 324 nt2.55□□□□□ -2
NOP56Q12460 YPR099CYPR099C 357 nt2.55□□□□□ -2
NOP56Q12460 CRM1YGR218W 3255 nt2.55□□□□□ -2
NOP56Q12460 NUP120YKL057C 3114 nt2.54□□□□□ -2
NOP56Q12460 YDL152WYDL152W 366 nt2.54□□□□□ -2
NOP56Q12460 MAM33YIL070C 801 nt2.54□□□□□ -2
NOP56Q12460 SNC1YAL030W 354 nt2.54□□□□□ -2
NOP56Q12460 HSK3YKL138C-A 210 nt2.54□□□□□ -2
NOP56Q12460 RPS27AYKL156W 249 nt2.54□□□□□ -2
NOP56Q12460 SMA2YML066C 1110 nt2.54□□□□□ -2
NOP56Q12460 YML099W-AYML099W-A 330 nt2.54□□□□□ -2
NOP56Q12460 YPL229WYPL229W 621 nt2.54□□□□□ -2
NOP56Q12460 DIS3YOL021C 3006 nt2.53□□□□□ -2
NOP56Q12460 YFH1YDL120W 525 nt2.53□□□□□ -2
NOP56Q12460 NHP2YDL208W 471 nt2.53□□□□□ -2
NOP56Q12460 YDR413CYDR413C 576 nt2.53□□□□□ -2
NOP56Q12460 PEX4YGR133W 552 nt2.53□□□□□ -2
NOP56Q12460 EMC6YLL014W 327 nt2.53□□□□□ -2
NOP56Q12460 YMR193C-AYMR193C-A 387 nt2.53□□□□□ -2
NOP56Q12460 YMR320WYMR320W 306 nt2.53□□□□□ -2
NOP56Q12460 YBL005W-BYBL005W-B 5268 nt2.52□□□□□ -2.01
NOP56Q12460 SNF5YBR289W 2718 nt2.52□□□□□ -2.01
NOP56Q12460 YDR102CYDR102C 333 nt2.52□□□□□ -2.01
NOP56Q12460 YIL115W-AYIL115W-A 372 nt2.52□□□□□ -2.01
NOP56Q12460 YML037CYML037C 1023 nt2.52□□□□□ -2.01
NOP56Q12460 ESL2YKR096W 3588 nt2.51□□□□□ -2.01
NOP56Q12460 MCD1YDL003W 1701 nt2.51□□□□□ -2.01
NOP56Q12460 SMY1YKL079W 1971 nt2.51□□□□□ -2.01
NOP56Q12460 TIM9YEL020W-A 264 nt2.51□□□□□ -2.01
NOP56Q12460 PSY1YKL076C 384 nt2.51□□□□□ -2.01
NOP56Q12460 YMR031W-AYMR031W-A 327 nt2.51□□□□□ -2.01
NOP56Q12460 HCH1YNL281W 462 nt2.51□□□□□ -2.01
NOP56Q12460 NOT5YPR072W 1683 nt2.5□□□□□ -2.01
NOP56Q12460 EDS1YBR033W 2760 nt2.5□□□□□ -2.01
NOP56Q12460 TRS130YMR218C 3309 nt2.5□□□□□ -2.01
NOP56Q12460 TOF2YKR010C 2316 nt2.5□□□□□ -2.01
NOP56Q12460 RPL23BYER117W 414 nt2.5□□□□□ -2.01
NOP56Q12460 YGL069CYGL069C 465 nt2.5□□□□□ -2.01
NOP56Q12460 OSW7YFR039C 1533 nt2.5□□□□□ -2.01
NOP56Q12460 PAN3YKL025C 2040 nt2.5□□□□□ -2.01
NOP56Q12460 CDC27YBL084C 2277 nt2.5□□□□□ -2.01
NOP56Q12460 CDC53YDL132W 2448 nt2.5□□□□□ -2.01
NOP56Q12460 YBP1YBR216C 2025 nt2.49□□□□□ -2.01 RIP-Chip
NOP56Q12460 BCK1YJL095W 4437 nt2.49□□□□□ -2.01
NOP56Q12460 YER097WYER097W 330 nt2.49□□□□□ -2.01
NOP56Q12460 YER181CYER181C 324 nt2.49□□□□□ -2.01
NOP56Q12460 YBR224WYBR224W 516 nt2.49□□□□□ -2.01
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