Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDE4DQ08499 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDE4DQ08499 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDE4DQ08499 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDE4DQ08499 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDE4DQ08499 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDE4DQ08499 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDE4DQ08499 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDE4DQ08499 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDE4DQ08499 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDE4DQ08499 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDE4DQ08499 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDE4DQ08499 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDE4DQ08499 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDE4DQ08499 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDE4DQ08499 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDE4DQ08499 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PDE4DQ08499 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDE4DQ08499 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PDE4DQ08499 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDE4DQ08499 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDE4DQ08499 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDE4DQ08499 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDE4DQ08499 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDE4DQ08499 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDE4DQ08499 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDE4DQ08499 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDE4DQ08499 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDE4DQ08499 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDE4DQ08499 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDE4DQ08499 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDE4DQ08499 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDE4DQ08499 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDE4DQ08499 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDE4DQ08499 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDE4DQ08499 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PDE4DQ08499 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDE4DQ08499 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDE4DQ08499 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDE4DQ08499 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDE4DQ08499 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDE4DQ08499 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDE4DQ08499 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDE4DQ08499 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDE4DQ08499 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDE4DQ08499 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDE4DQ08499 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDE4DQ08499 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDE4DQ08499 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDE4DQ08499 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDE4DQ08499 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDE4DQ08499 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDE4DQ08499 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDE4DQ08499 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDE4DQ08499 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDE4DQ08499 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDE4DQ08499 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDE4DQ08499 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDE4DQ08499 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PDE4DQ08499 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDE4DQ08499 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDE4DQ08499 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDE4DQ08499 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDE4DQ08499 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDE4DQ08499 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDE4DQ08499 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDE4DQ08499 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDE4DQ08499 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDE4DQ08499 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDE4DQ08499 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDE4DQ08499 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PDE4DQ08499 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PDE4DQ08499 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDE4DQ08499 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDE4DQ08499 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDE4DQ08499 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDE4DQ08499 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDE4DQ08499 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDE4DQ08499 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDE4DQ08499 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
PDE4DQ08499 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDE4DQ08499 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDE4DQ08499 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDE4DQ08499 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDE4DQ08499 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDE4DQ08499 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDE4DQ08499 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDE4DQ08499 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDE4DQ08499 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDE4DQ08499 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PDE4DQ08499 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDE4DQ08499 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDE4DQ08499 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PDE4DQ08499 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDE4DQ08499 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDE4DQ08499 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDE4DQ08499 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDE4DQ08499 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDE4DQ08499 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDE4DQ08499 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms