Protein–RNA interactions for Protein: Q08490

SGO1, Shugoshin, yeastyeast

Predictions only

Length 590 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SGO1Q08490 YER121WYER121W 345 nt2.85□□□□□ -1.95
SGO1Q08490 YIL169CYIL169C 2988 nt2.85□□□□□ -1.95
SGO1Q08490 YJL020W-AYJL020W-A 258 nt2.85□□□□□ -1.95
SGO1Q08490 YPR146CYPR146C 330 nt2.85□□□□□ -1.95
SGO1Q08490 SLN1YIL147C 3663 nt2.84□□□□□ -1.95
SGO1Q08490 RSN1YMR266W 2862 nt2.84□□□□□ -1.95
SGO1Q08490 HTL1YCR020W-B 237 nt2.84□□□□□ -1.95
SGO1Q08490 YDR048CYDR048C 315 nt2.84□□□□□ -1.95
SGO1Q08490 YIL066W-AYIL066W-A 444 nt2.84□□□□□ -1.95
SGO1Q08490 YKR033CYKR033C 426 nt2.84□□□□□ -1.95
SGO1Q08490 RPL6AYML073C 531 nt2.84□□□□□ -1.95
SGO1Q08490 YMR307C-AYMR307C-A 195 nt2.84□□□□□ -1.95
SGO1Q08490 YPL182CYPL182C 384 nt2.84□□□□□ -1.95
SGO1Q08490 ITC1YGL133W 3795 nt2.84□□□□□ -1.96
SGO1Q08490 PDR3YBL005W 2931 nt2.83□□□□□ -1.96
SGO1Q08490 RGR1YLR071C 3249 nt2.83□□□□□ -1.96
SGO1Q08490 YEL020C-BYEL020C-B 198 nt2.83□□□□□ -1.96
SGO1Q08490 ABF2YMR072W 552 nt2.83□□□□□ -1.96
SGO1Q08490 RGM1YMR182C 636 nt2.83□□□□□ -1.96
SGO1Q08490 RPL32YBL092W 393 nt2.83□□□□□ -1.96
SGO1Q08490 FLO11YIR019C 4104 nt2.83□□□□□ -1.96
SGO1Q08490 PUF6YDR496C 1971 nt2.83□□□□□ -1.96
SGO1Q08490 ARP7YPR034W 1434 nt2.83□□□□□ -1.96
SGO1Q08490 SEC7YDR170C 6030 nt2.83□□□□□ -1.96
SGO1Q08490 AIM9YER080W 1884 nt2.82□□□□□ -1.96
SGO1Q08490 NEW1YPL226W 3591 nt2.82□□□□□ -1.96
SGO1Q08490 AYR1YIL124W 894 nt2.82□□□□□ -1.96
SGO1Q08490 HSK3YKL138C-A 210 nt2.82□□□□□ -1.96
SGO1Q08490 SDH2YLL041C 801 nt2.82□□□□□ -1.96
SGO1Q08490 MF(ALPHA)1YPL187W 498 nt2.82□□□□□ -1.96
SGO1Q08490 snR49snR49 165 nt2.82□□□□□ -1.96
SGO1Q08490 TOM1YDR457W 9807 nt2.82□□□□□ -1.96
SGO1Q08490 DBP6YNR038W 1890 nt2.82□□□□□ -1.96
SGO1Q08490 PSY2YNL201C 2577 nt2.81□□□□□ -1.96
SGO1Q08490 YDR209CYDR209C 414 nt2.81□□□□□ -1.96
SGO1Q08490 PAM16YJL104W 450 nt2.81□□□□□ -1.96
SGO1Q08490 HTB2YBL002W 396 nt2.81□□□□□ -1.96
SGO1Q08490 YMR324CYMR324C 243 nt2.81□□□□□ -1.96
SGO1Q08490 RPL25YOL127W 429 nt2.81□□□□□ -1.96
SGO1Q08490 YBR197CYBR197C 654 nt2.81□□□□□ -1.96
SGO1Q08490 DAD3YBR233W-A 285 nt2.81□□□□□ -1.96
SGO1Q08490 YCL023CYCL023C 348 nt2.81□□□□□ -1.96
SGO1Q08490 SAP1YER047C 2694 nt2.81□□□□□ -1.96
SGO1Q08490 PFF1YBR074W 2931 nt2.81□□□□□ -1.96
SGO1Q08490 STE11YLR362W 2154 nt2.8□□□□□ -1.96
SGO1Q08490 MCD1YDL003W 1701 nt2.8□□□□□ -1.96
SGO1Q08490 snR76snR76 109 nt2.8□□□□□ -1.96
SGO1Q08490 YOL160WYOL160W 342 nt2.8□□□□□ -1.96
SGO1Q08490 YBR121C-AYBR121C-A 159 nt2.8□□□□□ -1.96
SGO1Q08490 RGA2YDR379W 3030 nt2.8□□□□□ -1.96
SGO1Q08490 YDR098C-BYDR098C-B 5268 nt2.8□□□□□ -1.96
SGO1Q08490 YDR210C-DYDR210C-D 5268 nt2.8□□□□□ -1.96
SGO1Q08490 YDR316W-BYDR316W-B 5268 nt2.8□□□□□ -1.96
SGO1Q08490 YDR365W-BYDR365W-B 5268 nt2.8□□□□□ -1.96
SGO1Q08490 YER138CYER138C 5268 nt2.8□□□□□ -1.96
SGO1Q08490 YER160CYER160C 5268 nt2.8□□□□□ -1.96
SGO1Q08490 YGR038C-BYGR038C-B 5268 nt2.8□□□□□ -1.96
SGO1Q08490 YGR161C-DYGR161C-D 5268 nt2.8□□□□□ -1.96
SGO1Q08490 YJR027WYJR027W 5268 nt2.8□□□□□ -1.96
SGO1Q08490 YLR157C-BYLR157C-B 5268 nt2.8□□□□□ -1.96
SGO1Q08490 YML039WYML039W 5268 nt2.8□□□□□ -1.96
SGO1Q08490 YML045WYML045W 5268 nt2.8□□□□□ -1.96
SGO1Q08490 YMR050CYMR050C 5268 nt2.8□□□□□ -1.96
SGO1Q08490 YOL103W-BYOL103W-B 5268 nt2.8□□□□□ -1.96
SGO1Q08490 YBR012W-BYBR012W-B 5271 nt2.8□□□□□ -1.96
SGO1Q08490 YOR142W-BYOR142W-B 5268 nt2.8□□□□□ -1.96
SGO1Q08490 YPL257W-BYPL257W-B 5268 nt2.8□□□□□ -1.96
SGO1Q08490 YPR158W-BYPR158W-B 5271 nt2.8□□□□□ -1.96
SGO1Q08490 DUF1YOL087C 3351 nt2.8□□□□□ -1.96
SGO1Q08490 RAD61YDR014W 1944 nt2.8□□□□□ -1.96
SGO1Q08490 YGR067CYGR067C 2415 nt2.79□□□□□ -1.96
SGO1Q08490 ISD11YER048W-A 285 nt2.79□□□□□ -1.96
SGO1Q08490 APQ12YIL040W 417 nt2.79□□□□□ -1.96
SGO1Q08490 PFD1YJL179W 330 nt2.79□□□□□ -1.96
SGO1Q08490 YAL059C-AYAL059C-A 423 nt2.79□□□□□ -1.96
SGO1Q08490 YJL070CYJL070C 2667 nt2.79□□□□□ -1.96
SGO1Q08490 IPT1YDR072C 1584 nt2.78□□□□□ -1.96
SGO1Q08490 BPT1YLL015W 4680 nt2.78□□□□□ -1.96
SGO1Q08490 HCS1YKL017C 2052 nt2.78□□□□□ -1.96
SGO1Q08490 ECM29YHL030W 5607 nt2.78□□□□□ -1.96
SGO1Q08490 YFH1YDL120W 525 nt2.78□□□□□ -1.96
SGO1Q08490 TIM13YGR181W 318 nt2.78□□□□□ -1.96
SGO1Q08490 RPL20AYMR242C 519 nt2.78□□□□□ -1.96
SGO1Q08490 TCB2YNL087W 3537 nt2.78□□□□□ -1.96
SGO1Q08490 GIN4YDR507C 3429 nt2.78□□□□□ -1.96
SGO1Q08490 UBP1YDL122W 2430 nt2.78□□□□□ -1.97
SGO1Q08490 SOK1YDR006C 2706 nt2.77□□□□□ -1.97
SGO1Q08490 YGL239CYGL239C 315 nt2.77□□□□□ -1.97
SGO1Q08490 YJL182CYJL182C 318 nt2.77□□□□□ -1.97
SGO1Q08490 YLR466C-BYLR466C-B 117 nt2.77□□□□□ -1.97
SGO1Q08490 YOL155W-AYOL155W-A 135 nt2.77□□□□□ -1.97
SGO1Q08490 IES4YOR189W 351 nt2.77□□□□□ -1.97
SGO1Q08490 YBR064WYBR064W 429 nt2.77□□□□□ -1.97
SGO1Q08490 YPL150WYPL150W 2706 nt2.77□□□□□ -1.97
SGO1Q08490 YLL032CYLL032C 2478 nt2.76□□□□□ -1.97
SGO1Q08490 YIL102CYIL102C 306 nt2.76□□□□□ -1.97
SGO1Q08490 RPS22AYJL190C 393 nt2.76□□□□□ -1.97
SGO1Q08490 LCL1YPL056C 306 nt2.76□□□□□ -1.97
SGO1Q08490 PRP8YHR165C 7242 nt2.75□□□□□ -1.97
SGO1Q08490 LSO2YGR169C-A 279 nt2.75□□□□□ -1.97
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