Protein–RNA interactions for Protein: Q07001

CHRND, Acetylcholine receptor subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNDQ07001 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHRNDQ07001 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHRNDQ07001 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHRNDQ07001 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHRNDQ07001 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHRNDQ07001 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHRNDQ07001 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHRNDQ07001 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHRNDQ07001 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHRNDQ07001 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHRNDQ07001 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHRNDQ07001 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CHRNDQ07001 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHRNDQ07001 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHRNDQ07001 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHRNDQ07001 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHRNDQ07001 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CHRNDQ07001 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHRNDQ07001 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHRNDQ07001 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHRNDQ07001 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHRNDQ07001 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHRNDQ07001 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHRNDQ07001 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHRNDQ07001 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHRNDQ07001 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHRNDQ07001 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHRNDQ07001 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHRNDQ07001 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHRNDQ07001 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHRNDQ07001 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHRNDQ07001 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHRNDQ07001 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CHRNDQ07001 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHRNDQ07001 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHRNDQ07001 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHRNDQ07001 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHRNDQ07001 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHRNDQ07001 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHRNDQ07001 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHRNDQ07001 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHRNDQ07001 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHRNDQ07001 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHRNDQ07001 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHRNDQ07001 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHRNDQ07001 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHRNDQ07001 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHRNDQ07001 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CHRNDQ07001 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHRNDQ07001 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHRNDQ07001 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHRNDQ07001 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHRNDQ07001 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHRNDQ07001 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHRNDQ07001 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHRNDQ07001 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHRNDQ07001 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHRNDQ07001 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHRNDQ07001 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHRNDQ07001 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHRNDQ07001 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHRNDQ07001 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHRNDQ07001 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHRNDQ07001 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHRNDQ07001 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHRNDQ07001 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHRNDQ07001 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHRNDQ07001 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHRNDQ07001 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHRNDQ07001 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHRNDQ07001 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHRNDQ07001 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHRNDQ07001 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHRNDQ07001 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHRNDQ07001 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHRNDQ07001 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHRNDQ07001 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CHRNDQ07001 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CHRNDQ07001 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CHRNDQ07001 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CHRNDQ07001 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CHRNDQ07001 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CHRNDQ07001 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CHRNDQ07001 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CHRNDQ07001 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CHRNDQ07001 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CHRNDQ07001 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CHRNDQ07001 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CHRNDQ07001 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CHRNDQ07001 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CHRNDQ07001 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CHRNDQ07001 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CHRNDQ07001 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CHRNDQ07001 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CHRNDQ07001 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CHRNDQ07001 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHRNDQ07001 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHRNDQ07001 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHRNDQ07001 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHRNDQ07001 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms