Protein–RNA interactions for Protein: Q06889

EGR3, Early growth response protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR3Q06889 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EGR3Q06889 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EGR3Q06889 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EGR3Q06889 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EGR3Q06889 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EGR3Q06889 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EGR3Q06889 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EGR3Q06889 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EGR3Q06889 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EGR3Q06889 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
EGR3Q06889 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
EGR3Q06889 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
EGR3Q06889 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EGR3Q06889 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EGR3Q06889 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
EGR3Q06889 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EGR3Q06889 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EGR3Q06889 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EGR3Q06889 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EGR3Q06889 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EGR3Q06889 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EGR3Q06889 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EGR3Q06889 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EGR3Q06889 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EGR3Q06889 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EGR3Q06889 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EGR3Q06889 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EGR3Q06889 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EGR3Q06889 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EGR3Q06889 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EGR3Q06889 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EGR3Q06889 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EGR3Q06889 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EGR3Q06889 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EGR3Q06889 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EGR3Q06889 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EGR3Q06889 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EGR3Q06889 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EGR3Q06889 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EGR3Q06889 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
EGR3Q06889 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
EGR3Q06889 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
EGR3Q06889 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EGR3Q06889 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EGR3Q06889 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EGR3Q06889 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
EGR3Q06889 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EGR3Q06889 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EGR3Q06889 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EGR3Q06889 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EGR3Q06889 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EGR3Q06889 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EGR3Q06889 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EGR3Q06889 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EGR3Q06889 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EGR3Q06889 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EGR3Q06889 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EGR3Q06889 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EGR3Q06889 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EGR3Q06889 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EGR3Q06889 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EGR3Q06889 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EGR3Q06889 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EGR3Q06889 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EGR3Q06889 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EGR3Q06889 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EGR3Q06889 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EGR3Q06889 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EGR3Q06889 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EGR3Q06889 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EGR3Q06889 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EGR3Q06889 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EGR3Q06889 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EGR3Q06889 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EGR3Q06889 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EGR3Q06889 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EGR3Q06889 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EGR3Q06889 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EGR3Q06889 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EGR3Q06889 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EGR3Q06889 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EGR3Q06889 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EGR3Q06889 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EGR3Q06889 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EGR3Q06889 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EGR3Q06889 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EGR3Q06889 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EGR3Q06889 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EGR3Q06889 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EGR3Q06889 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
EGR3Q06889 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EGR3Q06889 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EGR3Q06889 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EGR3Q06889 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EGR3Q06889 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EGR3Q06889 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EGR3Q06889 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EGR3Q06889 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EGR3Q06889 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EGR3Q06889 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms