Protein–RNA interactions for Protein: Q06828

FMOD, Fibromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMODQ06828 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FMODQ06828 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FMODQ06828 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FMODQ06828 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FMODQ06828 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FMODQ06828 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FMODQ06828 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FMODQ06828 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FMODQ06828 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FMODQ06828 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FMODQ06828 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FMODQ06828 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FMODQ06828 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FMODQ06828 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FMODQ06828 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FMODQ06828 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
FMODQ06828 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FMODQ06828 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FMODQ06828 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FMODQ06828 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FMODQ06828 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FMODQ06828 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FMODQ06828 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FMODQ06828 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FMODQ06828 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FMODQ06828 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FMODQ06828 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FMODQ06828 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FMODQ06828 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FMODQ06828 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FMODQ06828 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FMODQ06828 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FMODQ06828 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FMODQ06828 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FMODQ06828 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
FMODQ06828 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FMODQ06828 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FMODQ06828 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FMODQ06828 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FMODQ06828 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FMODQ06828 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FMODQ06828 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FMODQ06828 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FMODQ06828 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FMODQ06828 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FMODQ06828 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FMODQ06828 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FMODQ06828 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FMODQ06828 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FMODQ06828 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FMODQ06828 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FMODQ06828 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FMODQ06828 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FMODQ06828 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FMODQ06828 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FMODQ06828 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FMODQ06828 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FMODQ06828 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FMODQ06828 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FMODQ06828 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FMODQ06828 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FMODQ06828 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FMODQ06828 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FMODQ06828 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FMODQ06828 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FMODQ06828 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FMODQ06828 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FMODQ06828 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FMODQ06828 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FMODQ06828 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FMODQ06828 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FMODQ06828 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FMODQ06828 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FMODQ06828 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FMODQ06828 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FMODQ06828 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FMODQ06828 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FMODQ06828 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FMODQ06828 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FMODQ06828 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FMODQ06828 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FMODQ06828 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FMODQ06828 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FMODQ06828 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FMODQ06828 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FMODQ06828 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
FMODQ06828 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FMODQ06828 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FMODQ06828 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
FMODQ06828 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
FMODQ06828 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FMODQ06828 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FMODQ06828 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FMODQ06828 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FMODQ06828 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FMODQ06828 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FMODQ06828 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FMODQ06828 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FMODQ06828 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FMODQ06828 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms