Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GABPAQ06546 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GABPAQ06546 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GABPAQ06546 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GABPAQ06546 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GABPAQ06546 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GABPAQ06546 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GABPAQ06546 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GABPAQ06546 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GABPAQ06546 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GABPAQ06546 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GABPAQ06546 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GABPAQ06546 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GABPAQ06546 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GABPAQ06546 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GABPAQ06546 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GABPAQ06546 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GABPAQ06546 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GABPAQ06546 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
GABPAQ06546 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GABPAQ06546 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GABPAQ06546 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GABPAQ06546 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GABPAQ06546 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GABPAQ06546 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GABPAQ06546 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GABPAQ06546 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GABPAQ06546 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GABPAQ06546 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GABPAQ06546 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GABPAQ06546 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GABPAQ06546 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GABPAQ06546 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
GABPAQ06546 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
GABPAQ06546 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GABPAQ06546 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GABPAQ06546 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GABPAQ06546 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GABPAQ06546 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GABPAQ06546 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GABPAQ06546 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GABPAQ06546 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GABPAQ06546 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GABPAQ06546 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
GABPAQ06546 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GABPAQ06546 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GABPAQ06546 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
GABPAQ06546 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GABPAQ06546 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GABPAQ06546 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GABPAQ06546 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GABPAQ06546 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GABPAQ06546 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GABPAQ06546 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GABPAQ06546 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GABPAQ06546 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GABPAQ06546 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
GABPAQ06546 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GABPAQ06546 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GABPAQ06546 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GABPAQ06546 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GABPAQ06546 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GABPAQ06546 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GABPAQ06546 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GABPAQ06546 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GABPAQ06546 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GABPAQ06546 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GABPAQ06546 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GABPAQ06546 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GABPAQ06546 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GABPAQ06546 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GABPAQ06546 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GABPAQ06546 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GABPAQ06546 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GABPAQ06546 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GABPAQ06546 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GABPAQ06546 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GABPAQ06546 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GABPAQ06546 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GABPAQ06546 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GABPAQ06546 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GABPAQ06546 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GABPAQ06546 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GABPAQ06546 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GABPAQ06546 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GABPAQ06546 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GABPAQ06546 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
GABPAQ06546 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GABPAQ06546 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GABPAQ06546 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GABPAQ06546 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GABPAQ06546 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GABPAQ06546 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GABPAQ06546 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GABPAQ06546 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GABPAQ06546 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GABPAQ06546 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GABPAQ06546 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GABPAQ06546 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GABPAQ06546 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms