Protein–RNA interactions for Protein: Q06265

EXOSC9, Exosome complex component RRP45, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC9Q06265 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
EXOSC9Q06265 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
EXOSC9Q06265 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
EXOSC9Q06265 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
EXOSC9Q06265 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
EXOSC9Q06265 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
EXOSC9Q06265 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
EXOSC9Q06265 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
EXOSC9Q06265 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
EXOSC9Q06265 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
EXOSC9Q06265 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
EXOSC9Q06265 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
EXOSC9Q06265 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
EXOSC9Q06265 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
EXOSC9Q06265 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
EXOSC9Q06265 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
EXOSC9Q06265 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
EXOSC9Q06265 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
EXOSC9Q06265 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
EXOSC9Q06265 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
EXOSC9Q06265 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
EXOSC9Q06265 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
EXOSC9Q06265 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
EXOSC9Q06265 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
EXOSC9Q06265 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
EXOSC9Q06265 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
EXOSC9Q06265 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
EXOSC9Q06265 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
EXOSC9Q06265 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
EXOSC9Q06265 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
EXOSC9Q06265 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
EXOSC9Q06265 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
EXOSC9Q06265 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
EXOSC9Q06265 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
EXOSC9Q06265 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
EXOSC9Q06265 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
EXOSC9Q06265 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
EXOSC9Q06265 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
EXOSC9Q06265 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
EXOSC9Q06265 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
EXOSC9Q06265 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
EXOSC9Q06265 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
EXOSC9Q06265 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
EXOSC9Q06265 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
EXOSC9Q06265 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
EXOSC9Q06265 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
EXOSC9Q06265 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
EXOSC9Q06265 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
EXOSC9Q06265 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
EXOSC9Q06265 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
EXOSC9Q06265 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
EXOSC9Q06265 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
EXOSC9Q06265 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
EXOSC9Q06265 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
EXOSC9Q06265 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
EXOSC9Q06265 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
EXOSC9Q06265 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
EXOSC9Q06265 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
EXOSC9Q06265 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
EXOSC9Q06265 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
EXOSC9Q06265 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
EXOSC9Q06265 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
EXOSC9Q06265 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
EXOSC9Q06265 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
EXOSC9Q06265 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
EXOSC9Q06265 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
EXOSC9Q06265 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
EXOSC9Q06265 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
EXOSC9Q06265 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
EXOSC9Q06265 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
EXOSC9Q06265 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
EXOSC9Q06265 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
EXOSC9Q06265 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
EXOSC9Q06265 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
EXOSC9Q06265 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
EXOSC9Q06265 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.79
EXOSC9Q06265 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
EXOSC9Q06265 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
EXOSC9Q06265 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
EXOSC9Q06265 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
EXOSC9Q06265 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
EXOSC9Q06265 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
EXOSC9Q06265 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
EXOSC9Q06265 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
EXOSC9Q06265 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
EXOSC9Q06265 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
EXOSC9Q06265 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
EXOSC9Q06265 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
EXOSC9Q06265 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
EXOSC9Q06265 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
EXOSC9Q06265 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
EXOSC9Q06265 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
EXOSC9Q06265 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
EXOSC9Q06265 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
EXOSC9Q06265 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
EXOSC9Q06265 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
EXOSC9Q06265 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
EXOSC9Q06265 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
EXOSC9Q06265 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
EXOSC9Q06265 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms