Protein–RNA interactions for Protein: Q05D60

DEUP1, Deuterosome assembly protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEUP1Q05D60 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DEUP1Q05D60 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DEUP1Q05D60 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DEUP1Q05D60 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DEUP1Q05D60 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DEUP1Q05D60 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DEUP1Q05D60 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DEUP1Q05D60 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DEUP1Q05D60 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DEUP1Q05D60 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DEUP1Q05D60 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DEUP1Q05D60 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DEUP1Q05D60 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DEUP1Q05D60 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
DEUP1Q05D60 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DEUP1Q05D60 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DEUP1Q05D60 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DEUP1Q05D60 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DEUP1Q05D60 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DEUP1Q05D60 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DEUP1Q05D60 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DEUP1Q05D60 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DEUP1Q05D60 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DEUP1Q05D60 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DEUP1Q05D60 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DEUP1Q05D60 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DEUP1Q05D60 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DEUP1Q05D60 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
DEUP1Q05D60 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DEUP1Q05D60 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DEUP1Q05D60 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DEUP1Q05D60 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DEUP1Q05D60 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
DEUP1Q05D60 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DEUP1Q05D60 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DEUP1Q05D60 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DEUP1Q05D60 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DEUP1Q05D60 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DEUP1Q05D60 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DEUP1Q05D60 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DEUP1Q05D60 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DEUP1Q05D60 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DEUP1Q05D60 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DEUP1Q05D60 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DEUP1Q05D60 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DEUP1Q05D60 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DEUP1Q05D60 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DEUP1Q05D60 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DEUP1Q05D60 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DEUP1Q05D60 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DEUP1Q05D60 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DEUP1Q05D60 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DEUP1Q05D60 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DEUP1Q05D60 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
DEUP1Q05D60 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DEUP1Q05D60 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DEUP1Q05D60 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DEUP1Q05D60 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DEUP1Q05D60 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DEUP1Q05D60 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DEUP1Q05D60 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DEUP1Q05D60 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DEUP1Q05D60 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DEUP1Q05D60 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DEUP1Q05D60 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DEUP1Q05D60 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DEUP1Q05D60 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DEUP1Q05D60 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DEUP1Q05D60 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DEUP1Q05D60 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DEUP1Q05D60 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DEUP1Q05D60 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DEUP1Q05D60 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DEUP1Q05D60 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DEUP1Q05D60 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DEUP1Q05D60 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DEUP1Q05D60 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DEUP1Q05D60 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DEUP1Q05D60 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DEUP1Q05D60 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DEUP1Q05D60 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DEUP1Q05D60 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DEUP1Q05D60 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DEUP1Q05D60 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DEUP1Q05D60 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DEUP1Q05D60 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
DEUP1Q05D60 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DEUP1Q05D60 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DEUP1Q05D60 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DEUP1Q05D60 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DEUP1Q05D60 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
DEUP1Q05D60 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DEUP1Q05D60 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
DEUP1Q05D60 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DEUP1Q05D60 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
DEUP1Q05D60 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
DEUP1Q05D60 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
DEUP1Q05D60 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
DEUP1Q05D60 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
DEUP1Q05D60 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms