Protein–RNA interactions for Protein: Q04756

HGFAC, Hepatocyte growth factor activator, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HGFACQ04756 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HGFACQ04756 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HGFACQ04756 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HGFACQ04756 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HGFACQ04756 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HGFACQ04756 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HGFACQ04756 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
HGFACQ04756 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
HGFACQ04756 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HGFACQ04756 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HGFACQ04756 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HGFACQ04756 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
HGFACQ04756 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HGFACQ04756 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
HGFACQ04756 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HGFACQ04756 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HGFACQ04756 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HGFACQ04756 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HGFACQ04756 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HGFACQ04756 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
HGFACQ04756 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HGFACQ04756 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HGFACQ04756 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HGFACQ04756 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HGFACQ04756 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HGFACQ04756 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HGFACQ04756 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HGFACQ04756 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HGFACQ04756 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HGFACQ04756 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HGFACQ04756 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HGFACQ04756 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HGFACQ04756 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HGFACQ04756 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HGFACQ04756 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HGFACQ04756 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HGFACQ04756 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HGFACQ04756 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HGFACQ04756 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HGFACQ04756 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HGFACQ04756 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HGFACQ04756 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HGFACQ04756 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
HGFACQ04756 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HGFACQ04756 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HGFACQ04756 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HGFACQ04756 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HGFACQ04756 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HGFACQ04756 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HGFACQ04756 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HGFACQ04756 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HGFACQ04756 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HGFACQ04756 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HGFACQ04756 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HGFACQ04756 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HGFACQ04756 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HGFACQ04756 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HGFACQ04756 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
HGFACQ04756 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HGFACQ04756 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HGFACQ04756 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
HGFACQ04756 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HGFACQ04756 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HGFACQ04756 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HGFACQ04756 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HGFACQ04756 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HGFACQ04756 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HGFACQ04756 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HGFACQ04756 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HGFACQ04756 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HGFACQ04756 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HGFACQ04756 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HGFACQ04756 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HGFACQ04756 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HGFACQ04756 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HGFACQ04756 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HGFACQ04756 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HGFACQ04756 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HGFACQ04756 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HGFACQ04756 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HGFACQ04756 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
HGFACQ04756 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HGFACQ04756 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
HGFACQ04756 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HGFACQ04756 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
HGFACQ04756 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HGFACQ04756 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HGFACQ04756 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HGFACQ04756 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HGFACQ04756 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
HGFACQ04756 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HGFACQ04756 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HGFACQ04756 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HGFACQ04756 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HGFACQ04756 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HGFACQ04756 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HGFACQ04756 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HGFACQ04756 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HGFACQ04756 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HGFACQ04756 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms