Protein–RNA interactions for Protein: Q02978

SLC25A11, Mitochondrial 2-oxoglutarate/malate carrier protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A11Q02978 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC25A11Q02978 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC25A11Q02978 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC25A11Q02978 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC25A11Q02978 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC25A11Q02978 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC25A11Q02978 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC25A11Q02978 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC25A11Q02978 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC25A11Q02978 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC25A11Q02978 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC25A11Q02978 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC25A11Q02978 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC25A11Q02978 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC25A11Q02978 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC25A11Q02978 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC25A11Q02978 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC25A11Q02978 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC25A11Q02978 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC25A11Q02978 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC25A11Q02978 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC25A11Q02978 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC25A11Q02978 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC25A11Q02978 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC25A11Q02978 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC25A11Q02978 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC25A11Q02978 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC25A11Q02978 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC25A11Q02978 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC25A11Q02978 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC25A11Q02978 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC25A11Q02978 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC25A11Q02978 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC25A11Q02978 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC25A11Q02978 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC25A11Q02978 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC25A11Q02978 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC25A11Q02978 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC25A11Q02978 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC25A11Q02978 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC25A11Q02978 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC25A11Q02978 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC25A11Q02978 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC25A11Q02978 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC25A11Q02978 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC25A11Q02978 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC25A11Q02978 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC25A11Q02978 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC25A11Q02978 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC25A11Q02978 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC25A11Q02978 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC25A11Q02978 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC25A11Q02978 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC25A11Q02978 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC25A11Q02978 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC25A11Q02978 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC25A11Q02978 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC25A11Q02978 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC25A11Q02978 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC25A11Q02978 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC25A11Q02978 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC25A11Q02978 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC25A11Q02978 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC25A11Q02978 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC25A11Q02978 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC25A11Q02978 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC25A11Q02978 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC25A11Q02978 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC25A11Q02978 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC25A11Q02978 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC25A11Q02978 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC25A11Q02978 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC25A11Q02978 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC25A11Q02978 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC25A11Q02978 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC25A11Q02978 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC25A11Q02978 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC25A11Q02978 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC25A11Q02978 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC25A11Q02978 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC25A11Q02978 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC25A11Q02978 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC25A11Q02978 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC25A11Q02978 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC25A11Q02978 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC25A11Q02978 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC25A11Q02978 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC25A11Q02978 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC25A11Q02978 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC25A11Q02978 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC25A11Q02978 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC25A11Q02978 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC25A11Q02978 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC25A11Q02978 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC25A11Q02978 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC25A11Q02978 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC25A11Q02978 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC25A11Q02978 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC25A11Q02978 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC25A11Q02978 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms