Protein–RNA interactions for Protein: Q02246

CNTN2, Contactin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN2Q02246 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNTN2Q02246 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNTN2Q02246 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNTN2Q02246 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNTN2Q02246 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNTN2Q02246 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNTN2Q02246 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNTN2Q02246 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNTN2Q02246 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNTN2Q02246 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CNTN2Q02246 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNTN2Q02246 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNTN2Q02246 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNTN2Q02246 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNTN2Q02246 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNTN2Q02246 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNTN2Q02246 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNTN2Q02246 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNTN2Q02246 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNTN2Q02246 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNTN2Q02246 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CNTN2Q02246 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CNTN2Q02246 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CNTN2Q02246 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CNTN2Q02246 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNTN2Q02246 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNTN2Q02246 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNTN2Q02246 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNTN2Q02246 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNTN2Q02246 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNTN2Q02246 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CNTN2Q02246 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNTN2Q02246 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNTN2Q02246 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNTN2Q02246 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNTN2Q02246 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNTN2Q02246 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNTN2Q02246 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNTN2Q02246 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNTN2Q02246 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNTN2Q02246 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNTN2Q02246 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNTN2Q02246 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNTN2Q02246 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNTN2Q02246 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNTN2Q02246 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNTN2Q02246 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNTN2Q02246 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNTN2Q02246 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CNTN2Q02246 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CNTN2Q02246 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNTN2Q02246 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNTN2Q02246 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CNTN2Q02246 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNTN2Q02246 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNTN2Q02246 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNTN2Q02246 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNTN2Q02246 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CNTN2Q02246 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNTN2Q02246 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNTN2Q02246 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNTN2Q02246 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNTN2Q02246 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNTN2Q02246 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNTN2Q02246 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNTN2Q02246 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNTN2Q02246 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNTN2Q02246 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNTN2Q02246 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CNTN2Q02246 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNTN2Q02246 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNTN2Q02246 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNTN2Q02246 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNTN2Q02246 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNTN2Q02246 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNTN2Q02246 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CNTN2Q02246 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNTN2Q02246 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNTN2Q02246 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNTN2Q02246 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNTN2Q02246 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNTN2Q02246 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNTN2Q02246 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNTN2Q02246 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNTN2Q02246 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNTN2Q02246 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CNTN2Q02246 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNTN2Q02246 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CNTN2Q02246 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNTN2Q02246 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNTN2Q02246 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNTN2Q02246 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNTN2Q02246 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNTN2Q02246 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CNTN2Q02246 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNTN2Q02246 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNTN2Q02246 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNTN2Q02246 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNTN2Q02246 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CNTN2Q02246 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms