Protein–RNA interactions for Protein: Q01892

SPIB, Transcription factor Spi-B, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIBQ01892 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SPIBQ01892 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SPIBQ01892 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SPIBQ01892 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SPIBQ01892 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SPIBQ01892 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SPIBQ01892 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SPIBQ01892 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SPIBQ01892 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SPIBQ01892 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SPIBQ01892 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SPIBQ01892 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SPIBQ01892 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SPIBQ01892 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SPIBQ01892 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SPIBQ01892 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
SPIBQ01892 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SPIBQ01892 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SPIBQ01892 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SPIBQ01892 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
SPIBQ01892 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SPIBQ01892 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
SPIBQ01892 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SPIBQ01892 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SPIBQ01892 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
SPIBQ01892 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SPIBQ01892 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SPIBQ01892 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SPIBQ01892 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SPIBQ01892 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SPIBQ01892 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SPIBQ01892 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SPIBQ01892 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SPIBQ01892 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SPIBQ01892 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SPIBQ01892 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SPIBQ01892 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SPIBQ01892 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SPIBQ01892 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SPIBQ01892 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SPIBQ01892 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SPIBQ01892 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SPIBQ01892 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SPIBQ01892 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SPIBQ01892 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SPIBQ01892 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SPIBQ01892 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
SPIBQ01892 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SPIBQ01892 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
SPIBQ01892 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SPIBQ01892 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SPIBQ01892 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SPIBQ01892 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SPIBQ01892 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SPIBQ01892 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SPIBQ01892 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SPIBQ01892 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SPIBQ01892 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SPIBQ01892 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SPIBQ01892 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SPIBQ01892 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SPIBQ01892 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SPIBQ01892 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SPIBQ01892 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SPIBQ01892 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SPIBQ01892 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SPIBQ01892 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SPIBQ01892 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SPIBQ01892 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SPIBQ01892 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SPIBQ01892 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SPIBQ01892 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SPIBQ01892 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SPIBQ01892 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SPIBQ01892 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SPIBQ01892 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SPIBQ01892 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SPIBQ01892 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SPIBQ01892 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SPIBQ01892 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SPIBQ01892 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SPIBQ01892 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SPIBQ01892 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SPIBQ01892 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SPIBQ01892 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SPIBQ01892 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SPIBQ01892 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPIBQ01892 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPIBQ01892 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPIBQ01892 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPIBQ01892 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPIBQ01892 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPIBQ01892 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPIBQ01892 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPIBQ01892 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPIBQ01892 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPIBQ01892 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPIBQ01892 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPIBQ01892 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPIBQ01892 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms