Protein–RNA interactions for Protein: Q01850

CDR2, Cerebellar degeneration-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDR2Q01850 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDR2Q01850 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDR2Q01850 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDR2Q01850 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDR2Q01850 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDR2Q01850 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDR2Q01850 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDR2Q01850 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDR2Q01850 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDR2Q01850 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDR2Q01850 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDR2Q01850 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDR2Q01850 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDR2Q01850 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDR2Q01850 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDR2Q01850 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDR2Q01850 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CDR2Q01850 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDR2Q01850 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDR2Q01850 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDR2Q01850 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDR2Q01850 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDR2Q01850 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDR2Q01850 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDR2Q01850 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDR2Q01850 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDR2Q01850 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDR2Q01850 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDR2Q01850 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDR2Q01850 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CDR2Q01850 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDR2Q01850 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDR2Q01850 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDR2Q01850 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDR2Q01850 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDR2Q01850 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDR2Q01850 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CDR2Q01850 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
CDR2Q01850 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CDR2Q01850 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CDR2Q01850 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CDR2Q01850 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CDR2Q01850 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CDR2Q01850 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CDR2Q01850 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDR2Q01850 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDR2Q01850 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDR2Q01850 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDR2Q01850 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDR2Q01850 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDR2Q01850 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDR2Q01850 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDR2Q01850 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDR2Q01850 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDR2Q01850 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDR2Q01850 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDR2Q01850 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDR2Q01850 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDR2Q01850 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDR2Q01850 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDR2Q01850 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDR2Q01850 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDR2Q01850 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CDR2Q01850 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDR2Q01850 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDR2Q01850 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDR2Q01850 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDR2Q01850 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDR2Q01850 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDR2Q01850 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDR2Q01850 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CDR2Q01850 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDR2Q01850 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDR2Q01850 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDR2Q01850 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDR2Q01850 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDR2Q01850 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CDR2Q01850 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDR2Q01850 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDR2Q01850 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDR2Q01850 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDR2Q01850 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDR2Q01850 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDR2Q01850 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDR2Q01850 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDR2Q01850 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDR2Q01850 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDR2Q01850 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDR2Q01850 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CDR2Q01850 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDR2Q01850 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDR2Q01850 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDR2Q01850 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CDR2Q01850 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CDR2Q01850 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDR2Q01850 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDR2Q01850 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDR2Q01850 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDR2Q01850 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDR2Q01850 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms