Protein–RNA interactions for Protein: Q01082

SPTBN1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN1Q01082 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPTBN1Q01082 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPTBN1Q01082 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPTBN1Q01082 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPTBN1Q01082 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPTBN1Q01082 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SPTBN1Q01082 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPTBN1Q01082 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPTBN1Q01082 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPTBN1Q01082 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SPTBN1Q01082 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPTBN1Q01082 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPTBN1Q01082 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPTBN1Q01082 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPTBN1Q01082 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPTBN1Q01082 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPTBN1Q01082 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPTBN1Q01082 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPTBN1Q01082 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPTBN1Q01082 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPTBN1Q01082 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPTBN1Q01082 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPTBN1Q01082 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPTBN1Q01082 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPTBN1Q01082 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPTBN1Q01082 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPTBN1Q01082 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPTBN1Q01082 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPTBN1Q01082 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPTBN1Q01082 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPTBN1Q01082 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPTBN1Q01082 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SPTBN1Q01082 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPTBN1Q01082 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPTBN1Q01082 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPTBN1Q01082 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPTBN1Q01082 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPTBN1Q01082 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SPTBN1Q01082 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPTBN1Q01082 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPTBN1Q01082 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPTBN1Q01082 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPTBN1Q01082 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPTBN1Q01082 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPTBN1Q01082 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPTBN1Q01082 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPTBN1Q01082 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPTBN1Q01082 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPTBN1Q01082 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPTBN1Q01082 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPTBN1Q01082 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPTBN1Q01082 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPTBN1Q01082 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPTBN1Q01082 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPTBN1Q01082 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPTBN1Q01082 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPTBN1Q01082 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPTBN1Q01082 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPTBN1Q01082 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPTBN1Q01082 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPTBN1Q01082 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPTBN1Q01082 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPTBN1Q01082 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SPTBN1Q01082 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPTBN1Q01082 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPTBN1Q01082 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPTBN1Q01082 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPTBN1Q01082 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPTBN1Q01082 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPTBN1Q01082 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPTBN1Q01082 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPTBN1Q01082 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPTBN1Q01082 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPTBN1Q01082 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPTBN1Q01082 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPTBN1Q01082 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPTBN1Q01082 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPTBN1Q01082 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPTBN1Q01082 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPTBN1Q01082 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPTBN1Q01082 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPTBN1Q01082 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPTBN1Q01082 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPTBN1Q01082 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPTBN1Q01082 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPTBN1Q01082 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPTBN1Q01082 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPTBN1Q01082 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPTBN1Q01082 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPTBN1Q01082 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPTBN1Q01082 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPTBN1Q01082 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SPTBN1Q01082 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPTBN1Q01082 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPTBN1Q01082 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPTBN1Q01082 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPTBN1Q01082 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPTBN1Q01082 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPTBN1Q01082 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SPTBN1Q01082 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms