Protein–RNA interactions for Protein: Q00537

CDK17, Cyclin-dependent kinase 17, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK17Q00537 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDK17Q00537 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDK17Q00537 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDK17Q00537 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDK17Q00537 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDK17Q00537 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDK17Q00537 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDK17Q00537 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDK17Q00537 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDK17Q00537 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDK17Q00537 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDK17Q00537 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDK17Q00537 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDK17Q00537 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDK17Q00537 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDK17Q00537 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDK17Q00537 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDK17Q00537 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDK17Q00537 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDK17Q00537 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDK17Q00537 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDK17Q00537 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDK17Q00537 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDK17Q00537 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDK17Q00537 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDK17Q00537 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDK17Q00537 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDK17Q00537 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDK17Q00537 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDK17Q00537 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDK17Q00537 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDK17Q00537 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDK17Q00537 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDK17Q00537 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CDK17Q00537 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDK17Q00537 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDK17Q00537 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDK17Q00537 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDK17Q00537 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDK17Q00537 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDK17Q00537 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDK17Q00537 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDK17Q00537 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDK17Q00537 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDK17Q00537 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDK17Q00537 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDK17Q00537 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDK17Q00537 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDK17Q00537 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDK17Q00537 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDK17Q00537 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDK17Q00537 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDK17Q00537 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDK17Q00537 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDK17Q00537 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDK17Q00537 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDK17Q00537 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDK17Q00537 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDK17Q00537 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDK17Q00537 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDK17Q00537 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDK17Q00537 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDK17Q00537 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDK17Q00537 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CDK17Q00537 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CDK17Q00537 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDK17Q00537 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDK17Q00537 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDK17Q00537 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CDK17Q00537 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CDK17Q00537 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDK17Q00537 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDK17Q00537 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDK17Q00537 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDK17Q00537 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDK17Q00537 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDK17Q00537 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDK17Q00537 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDK17Q00537 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDK17Q00537 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDK17Q00537 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDK17Q00537 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDK17Q00537 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDK17Q00537 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDK17Q00537 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDK17Q00537 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CDK17Q00537 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CDK17Q00537 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CDK17Q00537 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDK17Q00537 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDK17Q00537 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDK17Q00537 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDK17Q00537 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDK17Q00537 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDK17Q00537 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDK17Q00537 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDK17Q00537 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDK17Q00537 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDK17Q00537 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CDK17Q00537 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms