Protein–RNA interactions for Protein: Q00403

GTF2B, Transcription initiation factor IIB, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2BQ00403 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GTF2BQ00403 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GTF2BQ00403 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GTF2BQ00403 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GTF2BQ00403 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GTF2BQ00403 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTF2BQ00403 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTF2BQ00403 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTF2BQ00403 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTF2BQ00403 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTF2BQ00403 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTF2BQ00403 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTF2BQ00403 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTF2BQ00403 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTF2BQ00403 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTF2BQ00403 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTF2BQ00403 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTF2BQ00403 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTF2BQ00403 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTF2BQ00403 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTF2BQ00403 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF2BQ00403 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF2BQ00403 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF2BQ00403 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF2BQ00403 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF2BQ00403 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF2BQ00403 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF2BQ00403 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF2BQ00403 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF2BQ00403 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF2BQ00403 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF2BQ00403 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF2BQ00403 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF2BQ00403 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF2BQ00403 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF2BQ00403 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF2BQ00403 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF2BQ00403 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF2BQ00403 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF2BQ00403 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF2BQ00403 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF2BQ00403 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF2BQ00403 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF2BQ00403 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF2BQ00403 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTF2BQ00403 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTF2BQ00403 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTF2BQ00403 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTF2BQ00403 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTF2BQ00403 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTF2BQ00403 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTF2BQ00403 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTF2BQ00403 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTF2BQ00403 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTF2BQ00403 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTF2BQ00403 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTF2BQ00403 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTF2BQ00403 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTF2BQ00403 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTF2BQ00403 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GTF2BQ00403 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GTF2BQ00403 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GTF2BQ00403 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GTF2BQ00403 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GTF2BQ00403 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GTF2BQ00403 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GTF2BQ00403 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GTF2BQ00403 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GTF2BQ00403 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GTF2BQ00403 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GTF2BQ00403 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GTF2BQ00403 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GTF2BQ00403 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GTF2BQ00403 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GTF2BQ00403 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GTF2BQ00403 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GTF2BQ00403 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GTF2BQ00403 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GTF2BQ00403 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GTF2BQ00403 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GTF2BQ00403 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
GTF2BQ00403 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
GTF2BQ00403 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GTF2BQ00403 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GTF2BQ00403 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GTF2BQ00403 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GTF2BQ00403 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GTF2BQ00403 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GTF2BQ00403 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GTF2BQ00403 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GTF2BQ00403 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GTF2BQ00403 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GTF2BQ00403 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GTF2BQ00403 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GTF2BQ00403 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GTF2BQ00403 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GTF2BQ00403 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GTF2BQ00403 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GTF2BQ00403 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GTF2BQ00403 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms