Protein–RNA interactions for Protein: P98174

FGD1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD1P98174 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FGD1P98174 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
FGD1P98174 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FGD1P98174 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FGD1P98174 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FGD1P98174 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FGD1P98174 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FGD1P98174 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FGD1P98174 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FGD1P98174 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FGD1P98174 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FGD1P98174 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FGD1P98174 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
FGD1P98174 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
FGD1P98174 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
FGD1P98174 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FGD1P98174 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FGD1P98174 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FGD1P98174 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FGD1P98174 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FGD1P98174 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FGD1P98174 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FGD1P98174 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FGD1P98174 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FGD1P98174 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FGD1P98174 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FGD1P98174 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FGD1P98174 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FGD1P98174 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FGD1P98174 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FGD1P98174 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FGD1P98174 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FGD1P98174 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FGD1P98174 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FGD1P98174 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
FGD1P98174 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FGD1P98174 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
FGD1P98174 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
FGD1P98174 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
FGD1P98174 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FGD1P98174 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FGD1P98174 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FGD1P98174 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FGD1P98174 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FGD1P98174 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FGD1P98174 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
FGD1P98174 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FGD1P98174 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FGD1P98174 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FGD1P98174 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FGD1P98174 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FGD1P98174 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
FGD1P98174 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FGD1P98174 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
FGD1P98174 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FGD1P98174 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FGD1P98174 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FGD1P98174 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FGD1P98174 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FGD1P98174 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FGD1P98174 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FGD1P98174 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FGD1P98174 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FGD1P98174 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FGD1P98174 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FGD1P98174 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FGD1P98174 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FGD1P98174 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FGD1P98174 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FGD1P98174 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FGD1P98174 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FGD1P98174 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FGD1P98174 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FGD1P98174 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FGD1P98174 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FGD1P98174 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FGD1P98174 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FGD1P98174 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
FGD1P98174 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FGD1P98174 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FGD1P98174 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FGD1P98174 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FGD1P98174 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FGD1P98174 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FGD1P98174 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FGD1P98174 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FGD1P98174 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FGD1P98174 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FGD1P98174 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FGD1P98174 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FGD1P98174 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FGD1P98174 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FGD1P98174 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FGD1P98174 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FGD1P98174 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FGD1P98174 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FGD1P98174 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FGD1P98174 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FGD1P98174 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FGD1P98174 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms