Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
FAM3AP98173 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
FAM3AP98173 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
FAM3AP98173 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
FAM3AP98173 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
FAM3AP98173 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FAM3AP98173 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FAM3AP98173 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FAM3AP98173 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FAM3AP98173 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FAM3AP98173 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FAM3AP98173 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FAM3AP98173 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FAM3AP98173 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FAM3AP98173 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FAM3AP98173 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
FAM3AP98173 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FAM3AP98173 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FAM3AP98173 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FAM3AP98173 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FAM3AP98173 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FAM3AP98173 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FAM3AP98173 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FAM3AP98173 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FAM3AP98173 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FAM3AP98173 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FAM3AP98173 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FAM3AP98173 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FAM3AP98173 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FAM3AP98173 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FAM3AP98173 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FAM3AP98173 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FAM3AP98173 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FAM3AP98173 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FAM3AP98173 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FAM3AP98173 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FAM3AP98173 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FAM3AP98173 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FAM3AP98173 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FAM3AP98173 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FAM3AP98173 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FAM3AP98173 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FAM3AP98173 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FAM3AP98173 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FAM3AP98173 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
FAM3AP98173 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FAM3AP98173 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
FAM3AP98173 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FAM3AP98173 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FAM3AP98173 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FAM3AP98173 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FAM3AP98173 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FAM3AP98173 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FAM3AP98173 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FAM3AP98173 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FAM3AP98173 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FAM3AP98173 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FAM3AP98173 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FAM3AP98173 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FAM3AP98173 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FAM3AP98173 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FAM3AP98173 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FAM3AP98173 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FAM3AP98173 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
FAM3AP98173 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FAM3AP98173 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FAM3AP98173 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FAM3AP98173 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FAM3AP98173 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FAM3AP98173 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FAM3AP98173 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FAM3AP98173 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FAM3AP98173 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FAM3AP98173 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FAM3AP98173 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
FAM3AP98173 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FAM3AP98173 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FAM3AP98173 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FAM3AP98173 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FAM3AP98173 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FAM3AP98173 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FAM3AP98173 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FAM3AP98173 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
FAM3AP98173 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FAM3AP98173 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FAM3AP98173 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FAM3AP98173 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FAM3AP98173 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FAM3AP98173 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FAM3AP98173 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FAM3AP98173 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FAM3AP98173 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FAM3AP98173 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FAM3AP98173 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FAM3AP98173 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FAM3AP98173 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FAM3AP98173 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FAM3AP98173 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FAM3AP98173 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FAM3AP98173 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms