Protein–RNA interactions for Protein: P78412

IRX6, Iroquois-class homeodomain protein IRX-6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX6P78412 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
IRX6P78412 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
IRX6P78412 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
IRX6P78412 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
IRX6P78412 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
IRX6P78412 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
IRX6P78412 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
IRX6P78412 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
IRX6P78412 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
IRX6P78412 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
IRX6P78412 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
IRX6P78412 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
IRX6P78412 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
IRX6P78412 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
IRX6P78412 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
IRX6P78412 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
IRX6P78412 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
IRX6P78412 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
IRX6P78412 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
IRX6P78412 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
IRX6P78412 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
IRX6P78412 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
IRX6P78412 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
IRX6P78412 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
IRX6P78412 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
IRX6P78412 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
IRX6P78412 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
IRX6P78412 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
IRX6P78412 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
IRX6P78412 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
IRX6P78412 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
IRX6P78412 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
IRX6P78412 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
IRX6P78412 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
IRX6P78412 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
IRX6P78412 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
IRX6P78412 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
IRX6P78412 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
IRX6P78412 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
IRX6P78412 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
IRX6P78412 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
IRX6P78412 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
IRX6P78412 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
IRX6P78412 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
IRX6P78412 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
IRX6P78412 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
IRX6P78412 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
IRX6P78412 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
IRX6P78412 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
IRX6P78412 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
IRX6P78412 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
IRX6P78412 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
IRX6P78412 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
IRX6P78412 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
IRX6P78412 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
IRX6P78412 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
IRX6P78412 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
IRX6P78412 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
IRX6P78412 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
IRX6P78412 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
IRX6P78412 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
IRX6P78412 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
IRX6P78412 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
IRX6P78412 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
IRX6P78412 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
IRX6P78412 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
IRX6P78412 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
IRX6P78412 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
IRX6P78412 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
IRX6P78412 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
IRX6P78412 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
IRX6P78412 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
IRX6P78412 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
IRX6P78412 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
IRX6P78412 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
IRX6P78412 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
IRX6P78412 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
IRX6P78412 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
IRX6P78412 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
IRX6P78412 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
IRX6P78412 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
IRX6P78412 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
IRX6P78412 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
IRX6P78412 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
IRX6P78412 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
IRX6P78412 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.82
IRX6P78412 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
IRX6P78412 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
IRX6P78412 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
IRX6P78412 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
IRX6P78412 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
IRX6P78412 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
IRX6P78412 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
IRX6P78412 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
IRX6P78412 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
IRX6P78412 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
IRX6P78412 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
IRX6P78412 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
IRX6P78412 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
IRX6P78412 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms