Protein–RNA interactions for Protein: P61568

ERVK11-1, Putative endogenous retrovirus group K member 11-1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK11-1P61568 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVK11-1P61568 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVK11-1P61568 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVK11-1P61568 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVK11-1P61568 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVK11-1P61568 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVK11-1P61568 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVK11-1P61568 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVK11-1P61568 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVK11-1P61568 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVK11-1P61568 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVK11-1P61568 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVK11-1P61568 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVK11-1P61568 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVK11-1P61568 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVK11-1P61568 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVK11-1P61568 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVK11-1P61568 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVK11-1P61568 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVK11-1P61568 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVK11-1P61568 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVK11-1P61568 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVK11-1P61568 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVK11-1P61568 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVK11-1P61568 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVK11-1P61568 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVK11-1P61568 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVK11-1P61568 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVK11-1P61568 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVK11-1P61568 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVK11-1P61568 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVK11-1P61568 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVK11-1P61568 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVK11-1P61568 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVK11-1P61568 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVK11-1P61568 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVK11-1P61568 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVK11-1P61568 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVK11-1P61568 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVK11-1P61568 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVK11-1P61568 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVK11-1P61568 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVK11-1P61568 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVK11-1P61568 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVK11-1P61568 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVK11-1P61568 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVK11-1P61568 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVK11-1P61568 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVK11-1P61568 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVK11-1P61568 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVK11-1P61568 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVK11-1P61568 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVK11-1P61568 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVK11-1P61568 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVK11-1P61568 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVK11-1P61568 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVK11-1P61568 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVK11-1P61568 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVK11-1P61568 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVK11-1P61568 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ERVK11-1P61568 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ERVK11-1P61568 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
ERVK11-1P61568 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ERVK11-1P61568 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ERVK11-1P61568 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ERVK11-1P61568 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVK11-1P61568 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVK11-1P61568 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVK11-1P61568 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVK11-1P61568 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVK11-1P61568 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVK11-1P61568 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVK11-1P61568 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVK11-1P61568 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVK11-1P61568 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVK11-1P61568 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVK11-1P61568 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVK11-1P61568 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVK11-1P61568 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVK11-1P61568 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVK11-1P61568 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVK11-1P61568 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVK11-1P61568 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVK11-1P61568 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVK11-1P61568 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVK11-1P61568 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVK11-1P61568 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVK11-1P61568 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVK11-1P61568 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVK11-1P61568 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVK11-1P61568 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVK11-1P61568 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVK11-1P61568 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVK11-1P61568 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVK11-1P61568 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVK11-1P61568 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVK11-1P61568 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVK11-1P61568 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVK11-1P61568 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVK11-1P61568 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms