Protein–RNA interactions for Protein: P61019

RAB2A, Ras-related protein Rab-2A, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB2AP61019 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB2AP61019 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB2AP61019 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB2AP61019 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB2AP61019 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB2AP61019 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB2AP61019 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB2AP61019 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB2AP61019 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB2AP61019 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB2AP61019 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB2AP61019 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB2AP61019 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB2AP61019 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB2AP61019 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB2AP61019 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB2AP61019 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB2AP61019 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB2AP61019 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB2AP61019 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB2AP61019 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB2AP61019 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB2AP61019 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB2AP61019 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB2AP61019 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB2AP61019 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB2AP61019 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB2AP61019 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB2AP61019 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB2AP61019 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB2AP61019 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB2AP61019 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB2AP61019 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB2AP61019 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB2AP61019 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB2AP61019 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB2AP61019 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAB2AP61019 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAB2AP61019 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAB2AP61019 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAB2AP61019 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAB2AP61019 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAB2AP61019 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAB2AP61019 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB2AP61019 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB2AP61019 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB2AP61019 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB2AP61019 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB2AP61019 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB2AP61019 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB2AP61019 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB2AP61019 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB2AP61019 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB2AP61019 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB2AP61019 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB2AP61019 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB2AP61019 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB2AP61019 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB2AP61019 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB2AP61019 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB2AP61019 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB2AP61019 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB2AP61019 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB2AP61019 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB2AP61019 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB2AP61019 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB2AP61019 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB2AP61019 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB2AP61019 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB2AP61019 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB2AP61019 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB2AP61019 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB2AP61019 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB2AP61019 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB2AP61019 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB2AP61019 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB2AP61019 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB2AP61019 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB2AP61019 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB2AP61019 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB2AP61019 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB2AP61019 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB2AP61019 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB2AP61019 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB2AP61019 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB2AP61019 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB2AP61019 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB2AP61019 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB2AP61019 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB2AP61019 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB2AP61019 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB2AP61019 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB2AP61019 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB2AP61019 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB2AP61019 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB2AP61019 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB2AP61019 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB2AP61019 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB2AP61019 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB2AP61019 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms