Protein–RNA interactions for Protein: P59894

DCDC1, Doublecortin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCDC1P59894 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DCDC1P59894 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DCDC1P59894 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DCDC1P59894 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DCDC1P59894 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DCDC1P59894 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DCDC1P59894 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DCDC1P59894 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DCDC1P59894 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DCDC1P59894 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DCDC1P59894 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DCDC1P59894 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.82
DCDC1P59894 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DCDC1P59894 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DCDC1P59894 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DCDC1P59894 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DCDC1P59894 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DCDC1P59894 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DCDC1P59894 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DCDC1P59894 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DCDC1P59894 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DCDC1P59894 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DCDC1P59894 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DCDC1P59894 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DCDC1P59894 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DCDC1P59894 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DCDC1P59894 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DCDC1P59894 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DCDC1P59894 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DCDC1P59894 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DCDC1P59894 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DCDC1P59894 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DCDC1P59894 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DCDC1P59894 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DCDC1P59894 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DCDC1P59894 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DCDC1P59894 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DCDC1P59894 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DCDC1P59894 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DCDC1P59894 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DCDC1P59894 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DCDC1P59894 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DCDC1P59894 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DCDC1P59894 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DCDC1P59894 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DCDC1P59894 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DCDC1P59894 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
DCDC1P59894 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DCDC1P59894 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DCDC1P59894 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DCDC1P59894 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DCDC1P59894 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DCDC1P59894 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DCDC1P59894 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DCDC1P59894 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DCDC1P59894 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DCDC1P59894 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DCDC1P59894 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DCDC1P59894 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DCDC1P59894 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DCDC1P59894 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DCDC1P59894 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DCDC1P59894 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DCDC1P59894 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DCDC1P59894 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DCDC1P59894 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DCDC1P59894 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DCDC1P59894 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DCDC1P59894 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DCDC1P59894 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DCDC1P59894 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DCDC1P59894 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DCDC1P59894 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DCDC1P59894 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DCDC1P59894 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DCDC1P59894 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DCDC1P59894 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DCDC1P59894 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DCDC1P59894 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DCDC1P59894 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DCDC1P59894 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
DCDC1P59894 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DCDC1P59894 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DCDC1P59894 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DCDC1P59894 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DCDC1P59894 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DCDC1P59894 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DCDC1P59894 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DCDC1P59894 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DCDC1P59894 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DCDC1P59894 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DCDC1P59894 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DCDC1P59894 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DCDC1P59894 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DCDC1P59894 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DCDC1P59894 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DCDC1P59894 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DCDC1P59894 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DCDC1P59894 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DCDC1P59894 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms