Protein–RNA interactions for Protein: P57772

EEFSEC, Selenocysteine-specific elongation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEFSECP57772 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
EEFSECP57772 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
EEFSECP57772 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
EEFSECP57772 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
EEFSECP57772 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
EEFSECP57772 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
EEFSECP57772 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
EEFSECP57772 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
EEFSECP57772 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
EEFSECP57772 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
EEFSECP57772 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
EEFSECP57772 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
EEFSECP57772 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
EEFSECP57772 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
EEFSECP57772 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
EEFSECP57772 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
EEFSECP57772 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
EEFSECP57772 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
EEFSECP57772 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
EEFSECP57772 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
EEFSECP57772 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
EEFSECP57772 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
EEFSECP57772 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
EEFSECP57772 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
EEFSECP57772 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
EEFSECP57772 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
EEFSECP57772 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
EEFSECP57772 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
EEFSECP57772 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
EEFSECP57772 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
EEFSECP57772 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
EEFSECP57772 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
EEFSECP57772 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
EEFSECP57772 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
EEFSECP57772 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
EEFSECP57772 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
EEFSECP57772 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
EEFSECP57772 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
EEFSECP57772 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
EEFSECP57772 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
EEFSECP57772 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
EEFSECP57772 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
EEFSECP57772 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
EEFSECP57772 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
EEFSECP57772 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
EEFSECP57772 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
EEFSECP57772 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
EEFSECP57772 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
EEFSECP57772 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
EEFSECP57772 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
EEFSECP57772 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
EEFSECP57772 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EEFSECP57772 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EEFSECP57772 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EEFSECP57772 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
EEFSECP57772 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
EEFSECP57772 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
EEFSECP57772 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EEFSECP57772 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EEFSECP57772 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
EEFSECP57772 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EEFSECP57772 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
EEFSECP57772 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
EEFSECP57772 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
EEFSECP57772 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EEFSECP57772 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
EEFSECP57772 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
EEFSECP57772 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EEFSECP57772 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EEFSECP57772 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EEFSECP57772 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
EEFSECP57772 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EEFSECP57772 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EEFSECP57772 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EEFSECP57772 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EEFSECP57772 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
EEFSECP57772 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EEFSECP57772 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EEFSECP57772 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EEFSECP57772 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EEFSECP57772 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EEFSECP57772 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
EEFSECP57772 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EEFSECP57772 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
EEFSECP57772 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
EEFSECP57772 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EEFSECP57772 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
EEFSECP57772 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
EEFSECP57772 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
EEFSECP57772 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
EEFSECP57772 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EEFSECP57772 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
EEFSECP57772 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
EEFSECP57772 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
EEFSECP57772 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
EEFSECP57772 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EEFSECP57772 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EEFSECP57772 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
EEFSECP57772 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EEFSECP57772 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.1 ms