Protein–RNA interactions for Protein: P55160

NCKAP1L, Nck-associated protein 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCKAP1LP55160 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NCKAP1LP55160 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NCKAP1LP55160 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NCKAP1LP55160 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NCKAP1LP55160 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NCKAP1LP55160 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NCKAP1LP55160 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NCKAP1LP55160 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NCKAP1LP55160 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NCKAP1LP55160 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NCKAP1LP55160 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NCKAP1LP55160 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NCKAP1LP55160 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NCKAP1LP55160 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NCKAP1LP55160 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NCKAP1LP55160 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NCKAP1LP55160 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NCKAP1LP55160 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NCKAP1LP55160 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NCKAP1LP55160 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NCKAP1LP55160 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NCKAP1LP55160 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NCKAP1LP55160 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NCKAP1LP55160 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NCKAP1LP55160 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NCKAP1LP55160 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NCKAP1LP55160 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NCKAP1LP55160 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NCKAP1LP55160 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NCKAP1LP55160 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NCKAP1LP55160 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NCKAP1LP55160 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NCKAP1LP55160 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NCKAP1LP55160 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NCKAP1LP55160 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NCKAP1LP55160 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
NCKAP1LP55160 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NCKAP1LP55160 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NCKAP1LP55160 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NCKAP1LP55160 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NCKAP1LP55160 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NCKAP1LP55160 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NCKAP1LP55160 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NCKAP1LP55160 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NCKAP1LP55160 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NCKAP1LP55160 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NCKAP1LP55160 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NCKAP1LP55160 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NCKAP1LP55160 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NCKAP1LP55160 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NCKAP1LP55160 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NCKAP1LP55160 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NCKAP1LP55160 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NCKAP1LP55160 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NCKAP1LP55160 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NCKAP1LP55160 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NCKAP1LP55160 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NCKAP1LP55160 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NCKAP1LP55160 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NCKAP1LP55160 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NCKAP1LP55160 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NCKAP1LP55160 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NCKAP1LP55160 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NCKAP1LP55160 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NCKAP1LP55160 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NCKAP1LP55160 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NCKAP1LP55160 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NCKAP1LP55160 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NCKAP1LP55160 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NCKAP1LP55160 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NCKAP1LP55160 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NCKAP1LP55160 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NCKAP1LP55160 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NCKAP1LP55160 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NCKAP1LP55160 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NCKAP1LP55160 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NCKAP1LP55160 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NCKAP1LP55160 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NCKAP1LP55160 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NCKAP1LP55160 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NCKAP1LP55160 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NCKAP1LP55160 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NCKAP1LP55160 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NCKAP1LP55160 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NCKAP1LP55160 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NCKAP1LP55160 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NCKAP1LP55160 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NCKAP1LP55160 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NCKAP1LP55160 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NCKAP1LP55160 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NCKAP1LP55160 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NCKAP1LP55160 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NCKAP1LP55160 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NCKAP1LP55160 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NCKAP1LP55160 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NCKAP1LP55160 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NCKAP1LP55160 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NCKAP1LP55160 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NCKAP1LP55160 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NCKAP1LP55160 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms