Protein–RNA interactions for Protein: P55058

PLTP, Phospholipid transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLTPP55058 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PLTPP55058 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PLTPP55058 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PLTPP55058 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PLTPP55058 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PLTPP55058 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PLTPP55058 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PLTPP55058 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PLTPP55058 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PLTPP55058 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PLTPP55058 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PLTPP55058 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PLTPP55058 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PLTPP55058 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PLTPP55058 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PLTPP55058 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PLTPP55058 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PLTPP55058 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PLTPP55058 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PLTPP55058 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PLTPP55058 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PLTPP55058 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PLTPP55058 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PLTPP55058 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PLTPP55058 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PLTPP55058 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PLTPP55058 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PLTPP55058 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PLTPP55058 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PLTPP55058 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PLTPP55058 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PLTPP55058 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PLTPP55058 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PLTPP55058 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PLTPP55058 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
PLTPP55058 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PLTPP55058 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PLTPP55058 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PLTPP55058 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PLTPP55058 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
PLTPP55058 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PLTPP55058 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PLTPP55058 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PLTPP55058 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PLTPP55058 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PLTPP55058 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PLTPP55058 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PLTPP55058 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PLTPP55058 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PLTPP55058 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PLTPP55058 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PLTPP55058 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PLTPP55058 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PLTPP55058 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PLTPP55058 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PLTPP55058 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PLTPP55058 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
PLTPP55058 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PLTPP55058 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PLTPP55058 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PLTPP55058 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PLTPP55058 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PLTPP55058 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
PLTPP55058 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PLTPP55058 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PLTPP55058 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PLTPP55058 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PLTPP55058 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PLTPP55058 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PLTPP55058 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PLTPP55058 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PLTPP55058 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PLTPP55058 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PLTPP55058 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PLTPP55058 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PLTPP55058 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PLTPP55058 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PLTPP55058 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PLTPP55058 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PLTPP55058 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PLTPP55058 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
PLTPP55058 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PLTPP55058 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PLTPP55058 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PLTPP55058 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PLTPP55058 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PLTPP55058 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PLTPP55058 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PLTPP55058 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PLTPP55058 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PLTPP55058 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PLTPP55058 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PLTPP55058 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PLTPP55058 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PLTPP55058 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PLTPP55058 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PLTPP55058 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PLTPP55058 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PLTPP55058 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PLTPP55058 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms