Protein–RNA interactions for Protein: P55011

SLC12A2, Solute carrier family 12 member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A2P55011 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC12A2P55011 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC12A2P55011 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC12A2P55011 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC12A2P55011 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC12A2P55011 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC12A2P55011 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC12A2P55011 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC12A2P55011 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC12A2P55011 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC12A2P55011 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC12A2P55011 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC12A2P55011 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC12A2P55011 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC12A2P55011 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC12A2P55011 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC12A2P55011 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC12A2P55011 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC12A2P55011 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC12A2P55011 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC12A2P55011 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC12A2P55011 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC12A2P55011 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC12A2P55011 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC12A2P55011 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC12A2P55011 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC12A2P55011 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC12A2P55011 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC12A2P55011 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC12A2P55011 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC12A2P55011 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC12A2P55011 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC12A2P55011 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC12A2P55011 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC12A2P55011 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC12A2P55011 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC12A2P55011 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC12A2P55011 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC12A2P55011 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC12A2P55011 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC12A2P55011 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC12A2P55011 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC12A2P55011 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC12A2P55011 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC12A2P55011 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC12A2P55011 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC12A2P55011 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC12A2P55011 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC12A2P55011 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC12A2P55011 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC12A2P55011 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC12A2P55011 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC12A2P55011 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC12A2P55011 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC12A2P55011 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC12A2P55011 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC12A2P55011 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC12A2P55011 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC12A2P55011 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC12A2P55011 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC12A2P55011 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC12A2P55011 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC12A2P55011 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC12A2P55011 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC12A2P55011 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC12A2P55011 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC12A2P55011 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC12A2P55011 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC12A2P55011 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC12A2P55011 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC12A2P55011 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC12A2P55011 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC12A2P55011 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC12A2P55011 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC12A2P55011 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC12A2P55011 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC12A2P55011 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC12A2P55011 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC12A2P55011 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC12A2P55011 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC12A2P55011 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC12A2P55011 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SLC12A2P55011 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
SLC12A2P55011 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
SLC12A2P55011 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SLC12A2P55011 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC12A2P55011 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC12A2P55011 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC12A2P55011 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC12A2P55011 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC12A2P55011 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC12A2P55011 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC12A2P55011 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC12A2P55011 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC12A2P55011 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC12A2P55011 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC12A2P55011 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC12A2P55011 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC12A2P55011 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC12A2P55011 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms