Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RAD23AP54725 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RAD23AP54725 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RAD23AP54725 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RAD23AP54725 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RAD23AP54725 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RAD23AP54725 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RAD23AP54725 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RAD23AP54725 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RAD23AP54725 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RAD23AP54725 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RAD23AP54725 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RAD23AP54725 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RAD23AP54725 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RAD23AP54725 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RAD23AP54725 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RAD23AP54725 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RAD23AP54725 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RAD23AP54725 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RAD23AP54725 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAD23AP54725 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAD23AP54725 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAD23AP54725 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAD23AP54725 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAD23AP54725 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAD23AP54725 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAD23AP54725 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAD23AP54725 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAD23AP54725 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAD23AP54725 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAD23AP54725 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAD23AP54725 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAD23AP54725 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAD23AP54725 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
RAD23AP54725 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAD23AP54725 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
RAD23AP54725 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
RAD23AP54725 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAD23AP54725 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAD23AP54725 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAD23AP54725 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAD23AP54725 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAD23AP54725 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAD23AP54725 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAD23AP54725 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RAD23AP54725 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RAD23AP54725 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RAD23AP54725 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RAD23AP54725 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RAD23AP54725 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RAD23AP54725 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RAD23AP54725 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RAD23AP54725 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RAD23AP54725 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RAD23AP54725 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RAD23AP54725 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RAD23AP54725 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RAD23AP54725 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RAD23AP54725 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RAD23AP54725 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RAD23AP54725 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RAD23AP54725 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RAD23AP54725 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RAD23AP54725 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RAD23AP54725 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RAD23AP54725 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RAD23AP54725 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RAD23AP54725 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RAD23AP54725 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RAD23AP54725 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RAD23AP54725 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RAD23AP54725 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RAD23AP54725 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RAD23AP54725 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RAD23AP54725 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RAD23AP54725 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RAD23AP54725 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RAD23AP54725 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
RAD23AP54725 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RAD23AP54725 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RAD23AP54725 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RAD23AP54725 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RAD23AP54725 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RAD23AP54725 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RAD23AP54725 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RAD23AP54725 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RAD23AP54725 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RAD23AP54725 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RAD23AP54725 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RAD23AP54725 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RAD23AP54725 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RAD23AP54725 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RAD23AP54725 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RAD23AP54725 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RAD23AP54725 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RAD23AP54725 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RAD23AP54725 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RAD23AP54725 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
RAD23AP54725 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
RAD23AP54725 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms