Protein–RNA interactions for Protein: P54646

PRKAA2, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAA2P54646 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PRKAA2P54646 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PRKAA2P54646 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PRKAA2P54646 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PRKAA2P54646 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PRKAA2P54646 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PRKAA2P54646 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PRKAA2P54646 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PRKAA2P54646 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PRKAA2P54646 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PRKAA2P54646 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PRKAA2P54646 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PRKAA2P54646 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PRKAA2P54646 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PRKAA2P54646 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PRKAA2P54646 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PRKAA2P54646 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PRKAA2P54646 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PRKAA2P54646 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PRKAA2P54646 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PRKAA2P54646 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PRKAA2P54646 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PRKAA2P54646 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PRKAA2P54646 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PRKAA2P54646 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PRKAA2P54646 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PRKAA2P54646 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PRKAA2P54646 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PRKAA2P54646 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PRKAA2P54646 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PRKAA2P54646 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PRKAA2P54646 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PRKAA2P54646 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PRKAA2P54646 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PRKAA2P54646 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PRKAA2P54646 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
PRKAA2P54646 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PRKAA2P54646 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
PRKAA2P54646 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
PRKAA2P54646 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PRKAA2P54646 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PRKAA2P54646 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PRKAA2P54646 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PRKAA2P54646 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PRKAA2P54646 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PRKAA2P54646 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PRKAA2P54646 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PRKAA2P54646 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PRKAA2P54646 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PRKAA2P54646 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PRKAA2P54646 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.79
PRKAA2P54646 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PRKAA2P54646 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PRKAA2P54646 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PRKAA2P54646 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PRKAA2P54646 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PRKAA2P54646 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PRKAA2P54646 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PRKAA2P54646 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PRKAA2P54646 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PRKAA2P54646 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
PRKAA2P54646 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PRKAA2P54646 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PRKAA2P54646 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PRKAA2P54646 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PRKAA2P54646 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PRKAA2P54646 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PRKAA2P54646 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PRKAA2P54646 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PRKAA2P54646 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PRKAA2P54646 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PRKAA2P54646 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PRKAA2P54646 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PRKAA2P54646 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PRKAA2P54646 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PRKAA2P54646 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PRKAA2P54646 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PRKAA2P54646 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PRKAA2P54646 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PRKAA2P54646 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PRKAA2P54646 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
PRKAA2P54646 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PRKAA2P54646 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PRKAA2P54646 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
PRKAA2P54646 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PRKAA2P54646 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PRKAA2P54646 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PRKAA2P54646 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PRKAA2P54646 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PRKAA2P54646 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
PRKAA2P54646 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PRKAA2P54646 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PRKAA2P54646 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PRKAA2P54646 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PRKAA2P54646 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PRKAA2P54646 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PRKAA2P54646 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
PRKAA2P54646 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PRKAA2P54646 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PRKAA2P54646 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms